Protein–RNA interactions for Protein: Q8NI35

PATJ, InaD-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATJQ8NI35 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
PATJQ8NI35 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PATJQ8NI35 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PATJQ8NI35 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PATJQ8NI35 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PATJQ8NI35 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PATJQ8NI35 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PATJQ8NI35 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PATJQ8NI35 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PATJQ8NI35 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PATJQ8NI35 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PATJQ8NI35 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
PATJQ8NI35 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PATJQ8NI35 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
PATJQ8NI35 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PATJQ8NI35 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PATJQ8NI35 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PATJQ8NI35 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
PATJQ8NI35 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
PATJQ8NI35 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
PATJQ8NI35 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
PATJQ8NI35 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
PATJQ8NI35 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
PATJQ8NI35 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
PATJQ8NI35 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
PATJQ8NI35 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
PATJQ8NI35 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PATJQ8NI35 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PATJQ8NI35 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PATJQ8NI35 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PATJQ8NI35 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PATJQ8NI35 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PATJQ8NI35 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PATJQ8NI35 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PATJQ8NI35 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PATJQ8NI35 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PATJQ8NI35 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PATJQ8NI35 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PATJQ8NI35 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PATJQ8NI35 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PATJQ8NI35 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PATJQ8NI35 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PATJQ8NI35 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PATJQ8NI35 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PATJQ8NI35 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PATJQ8NI35 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PATJQ8NI35 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PATJQ8NI35 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PATJQ8NI35 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PATJQ8NI35 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PATJQ8NI35 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PATJQ8NI35 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PATJQ8NI35 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PATJQ8NI35 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PATJQ8NI35 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PATJQ8NI35 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PATJQ8NI35 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PATJQ8NI35 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PATJQ8NI35 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PATJQ8NI35 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PATJQ8NI35 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PATJQ8NI35 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PATJQ8NI35 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
PATJQ8NI35 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PATJQ8NI35 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27■■□□□ 1.91
PATJQ8NI35 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PATJQ8NI35 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PATJQ8NI35 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
PATJQ8NI35 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PATJQ8NI35 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PATJQ8NI35 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PATJQ8NI35 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PATJQ8NI35 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PATJQ8NI35 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PATJQ8NI35 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PATJQ8NI35 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PATJQ8NI35 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
PATJQ8NI35 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PATJQ8NI35 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PATJQ8NI35 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PATJQ8NI35 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PATJQ8NI35 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PATJQ8NI35 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PATJQ8NI35 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PATJQ8NI35 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PATJQ8NI35 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PATJQ8NI35 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PATJQ8NI35 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PATJQ8NI35 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PATJQ8NI35 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PATJQ8NI35 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PATJQ8NI35 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PATJQ8NI35 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PATJQ8NI35 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PATJQ8NI35 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PATJQ8NI35 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PATJQ8NI35 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PATJQ8NI35 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
PATJQ8NI35 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PATJQ8NI35 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms