Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFD5

ARID1B, AT-rich interactive domain-containing protein 1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID1BQ8NFD5 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ARID1BQ8NFD5 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ARID1BQ8NFD5 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ARID1BQ8NFD5 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ARID1BQ8NFD5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ARID1BQ8NFD5 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ARID1BQ8NFD5 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ARID1BQ8NFD5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ARID1BQ8NFD5 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ARID1BQ8NFD5 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ARID1BQ8NFD5 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ARID1BQ8NFD5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ARID1BQ8NFD5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ARID1BQ8NFD5 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ARID1BQ8NFD5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ARID1BQ8NFD5 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ARID1BQ8NFD5 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ARID1BQ8NFD5 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ARID1BQ8NFD5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
ARID1BQ8NFD5 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ARID1BQ8NFD5 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ARID1BQ8NFD5 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ARID1BQ8NFD5 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ARID1BQ8NFD5 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ARID1BQ8NFD5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ARID1BQ8NFD5 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARID1BQ8NFD5 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARID1BQ8NFD5 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARID1BQ8NFD5 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARID1BQ8NFD5 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARID1BQ8NFD5 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARID1BQ8NFD5 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARID1BQ8NFD5 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARID1BQ8NFD5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARID1BQ8NFD5 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARID1BQ8NFD5 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
ARID1BQ8NFD5 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
ARID1BQ8NFD5 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
ARID1BQ8NFD5 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARID1BQ8NFD5 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARID1BQ8NFD5 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARID1BQ8NFD5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARID1BQ8NFD5 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARID1BQ8NFD5 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARID1BQ8NFD5 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
ARID1BQ8NFD5 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARID1BQ8NFD5 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARID1BQ8NFD5 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ARID1BQ8NFD5 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ARID1BQ8NFD5 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARID1BQ8NFD5 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARID1BQ8NFD5 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARID1BQ8NFD5 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARID1BQ8NFD5 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARID1BQ8NFD5 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARID1BQ8NFD5 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARID1BQ8NFD5 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARID1BQ8NFD5 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ARID1BQ8NFD5 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARID1BQ8NFD5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARID1BQ8NFD5 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARID1BQ8NFD5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARID1BQ8NFD5 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ARID1BQ8NFD5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ARID1BQ8NFD5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ARID1BQ8NFD5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ARID1BQ8NFD5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ARID1BQ8NFD5 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ARID1BQ8NFD5 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ARID1BQ8NFD5 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ARID1BQ8NFD5 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ARID1BQ8NFD5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ARID1BQ8NFD5 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ARID1BQ8NFD5 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ARID1BQ8NFD5 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ARID1BQ8NFD5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARID1BQ8NFD5 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARID1BQ8NFD5 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARID1BQ8NFD5 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARID1BQ8NFD5 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARID1BQ8NFD5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARID1BQ8NFD5 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ARID1BQ8NFD5 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARID1BQ8NFD5 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ARID1BQ8NFD5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARID1BQ8NFD5 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
ARID1BQ8NFD5 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARID1BQ8NFD5 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARID1BQ8NFD5 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARID1BQ8NFD5 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARID1BQ8NFD5 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
ARID1BQ8NFD5 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARID1BQ8NFD5 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARID1BQ8NFD5 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARID1BQ8NFD5 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARID1BQ8NFD5 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARID1BQ8NFD5 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARID1BQ8NFD5 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARID1BQ8NFD5 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
ARID1BQ8NFD5 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms