Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFA0

USP32, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 32, humanhuman

Predictions only

Length 1,604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP32Q8NFA0 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC36.04■■■■□ 3.36
USP32Q8NFA0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
USP32Q8NFA0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
USP32Q8NFA0 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
USP32Q8NFA0 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
USP32Q8NFA0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
USP32Q8NFA0 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
USP32Q8NFA0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
USP32Q8NFA0 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
USP32Q8NFA0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
USP32Q8NFA0 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC35.99■■■■□ 3.35
USP32Q8NFA0 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
USP32Q8NFA0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
USP32Q8NFA0 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
USP32Q8NFA0 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
USP32Q8NFA0 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
USP32Q8NFA0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
USP32Q8NFA0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
USP32Q8NFA0 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
USP32Q8NFA0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
USP32Q8NFA0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
USP32Q8NFA0 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
USP32Q8NFA0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
USP32Q8NFA0 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC35.96■■■■□ 3.35
USP32Q8NFA0 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC35.96■■■■□ 3.35
USP32Q8NFA0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
USP32Q8NFA0 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
USP32Q8NFA0 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC35.95■■■■□ 3.35
USP32Q8NFA0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.94■■■■□ 3.34
USP32Q8NFA0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
USP32Q8NFA0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
USP32Q8NFA0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
USP32Q8NFA0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
USP32Q8NFA0 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
USP32Q8NFA0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
USP32Q8NFA0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
USP32Q8NFA0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
USP32Q8NFA0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
USP32Q8NFA0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
USP32Q8NFA0 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
USP32Q8NFA0 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
USP32Q8NFA0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC35.92■■■■□ 3.34
USP32Q8NFA0 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
USP32Q8NFA0 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
USP32Q8NFA0 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
USP32Q8NFA0 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC35.9■■■■□ 3.34
USP32Q8NFA0 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
USP32Q8NFA0 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC35.9■■■■□ 3.34
USP32Q8NFA0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.9■■■■□ 3.34
USP32Q8NFA0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
USP32Q8NFA0 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
USP32Q8NFA0 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
USP32Q8NFA0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
USP32Q8NFA0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.87■■■■□ 3.33
USP32Q8NFA0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
USP32Q8NFA0 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
USP32Q8NFA0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC35.85■■■■□ 3.33
USP32Q8NFA0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
USP32Q8NFA0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
USP32Q8NFA0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC35.84■■■■□ 3.33
USP32Q8NFA0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
USP32Q8NFA0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
USP32Q8NFA0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
USP32Q8NFA0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
USP32Q8NFA0 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.33
USP32Q8NFA0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
USP32Q8NFA0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
USP32Q8NFA0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
USP32Q8NFA0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
USP32Q8NFA0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
USP32Q8NFA0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
USP32Q8NFA0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC35.78■■■■□ 3.32
USP32Q8NFA0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
USP32Q8NFA0 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
USP32Q8NFA0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
USP32Q8NFA0 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
USP32Q8NFA0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
USP32Q8NFA0 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.77■■■■□ 3.32
USP32Q8NFA0 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
USP32Q8NFA0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC35.76■■■■□ 3.32
USP32Q8NFA0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
USP32Q8NFA0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.31
USP32Q8NFA0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
USP32Q8NFA0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
USP32Q8NFA0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
USP32Q8NFA0 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
USP32Q8NFA0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
USP32Q8NFA0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
USP32Q8NFA0 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
USP32Q8NFA0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC35.73■■■■□ 3.31
USP32Q8NFA0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
USP32Q8NFA0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC35.73■■■■□ 3.31
USP32Q8NFA0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC35.72■■■■□ 3.31
USP32Q8NFA0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
USP32Q8NFA0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
USP32Q8NFA0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
USP32Q8NFA0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
USP32Q8NFA0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
USP32Q8NFA0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
USP32Q8NFA0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms