Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEC5

CATSPER1, Cation channel sperm-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CATSPER1Q8NEC5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CATSPER1Q8NEC5 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CATSPER1Q8NEC5 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CATSPER1Q8NEC5 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CATSPER1Q8NEC5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CATSPER1Q8NEC5 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CATSPER1Q8NEC5 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CATSPER1Q8NEC5 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CATSPER1Q8NEC5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CATSPER1Q8NEC5 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CATSPER1Q8NEC5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CATSPER1Q8NEC5 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CATSPER1Q8NEC5 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CATSPER1Q8NEC5 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CATSPER1Q8NEC5 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CATSPER1Q8NEC5 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CATSPER1Q8NEC5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CATSPER1Q8NEC5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CATSPER1Q8NEC5 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CATSPER1Q8NEC5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CATSPER1Q8NEC5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CATSPER1Q8NEC5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CATSPER1Q8NEC5 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CATSPER1Q8NEC5 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CATSPER1Q8NEC5 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CATSPER1Q8NEC5 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CATSPER1Q8NEC5 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CATSPER1Q8NEC5 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CATSPER1Q8NEC5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CATSPER1Q8NEC5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CATSPER1Q8NEC5 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CATSPER1Q8NEC5 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CATSPER1Q8NEC5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CATSPER1Q8NEC5 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CATSPER1Q8NEC5 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CATSPER1Q8NEC5 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CATSPER1Q8NEC5 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CATSPER1Q8NEC5 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CATSPER1Q8NEC5 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CATSPER1Q8NEC5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CATSPER1Q8NEC5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CATSPER1Q8NEC5 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CATSPER1Q8NEC5 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CATSPER1Q8NEC5 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CATSPER1Q8NEC5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CATSPER1Q8NEC5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CATSPER1Q8NEC5 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CATSPER1Q8NEC5 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CATSPER1Q8NEC5 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CATSPER1Q8NEC5 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CATSPER1Q8NEC5 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CATSPER1Q8NEC5 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CATSPER1Q8NEC5 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CATSPER1Q8NEC5 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CATSPER1Q8NEC5 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CATSPER1Q8NEC5 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CATSPER1Q8NEC5 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CATSPER1Q8NEC5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CATSPER1Q8NEC5 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CATSPER1Q8NEC5 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CATSPER1Q8NEC5 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CATSPER1Q8NEC5 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CATSPER1Q8NEC5 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CATSPER1Q8NEC5 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CATSPER1Q8NEC5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CATSPER1Q8NEC5 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CATSPER1Q8NEC5 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CATSPER1Q8NEC5 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CATSPER1Q8NEC5 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CATSPER1Q8NEC5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CATSPER1Q8NEC5 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CATSPER1Q8NEC5 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CATSPER1Q8NEC5 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CATSPER1Q8NEC5 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CATSPER1Q8NEC5 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CATSPER1Q8NEC5 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CATSPER1Q8NEC5 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CATSPER1Q8NEC5 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CATSPER1Q8NEC5 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CATSPER1Q8NEC5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CATSPER1Q8NEC5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CATSPER1Q8NEC5 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CATSPER1Q8NEC5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CATSPER1Q8NEC5 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CATSPER1Q8NEC5 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CATSPER1Q8NEC5 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CATSPER1Q8NEC5 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CATSPER1Q8NEC5 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CATSPER1Q8NEC5 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CATSPER1Q8NEC5 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CATSPER1Q8NEC5 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CATSPER1Q8NEC5 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CATSPER1Q8NEC5 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CATSPER1Q8NEC5 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CATSPER1Q8NEC5 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CATSPER1Q8NEC5 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CATSPER1Q8NEC5 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CATSPER1Q8NEC5 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CATSPER1Q8NEC5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CATSPER1Q8NEC5 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms