Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU1

CCDC197, Putative uncharacterized protein CCDC197, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC197Q8NCU1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC197Q8NCU1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC197Q8NCU1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC197Q8NCU1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC197Q8NCU1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC197Q8NCU1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC197Q8NCU1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC197Q8NCU1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC197Q8NCU1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC197Q8NCU1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC197Q8NCU1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC197Q8NCU1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC197Q8NCU1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC197Q8NCU1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC197Q8NCU1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC197Q8NCU1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC197Q8NCU1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC197Q8NCU1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC197Q8NCU1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC197Q8NCU1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC197Q8NCU1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC197Q8NCU1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC197Q8NCU1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CCDC197Q8NCU1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CCDC197Q8NCU1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC197Q8NCU1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC197Q8NCU1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC197Q8NCU1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC197Q8NCU1 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC197Q8NCU1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC197Q8NCU1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC197Q8NCU1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC197Q8NCU1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC197Q8NCU1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC197Q8NCU1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC197Q8NCU1 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC197Q8NCU1 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC197Q8NCU1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC197Q8NCU1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC197Q8NCU1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC197Q8NCU1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC197Q8NCU1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC197Q8NCU1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC197Q8NCU1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC197Q8NCU1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC197Q8NCU1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC197Q8NCU1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC197Q8NCU1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC197Q8NCU1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC197Q8NCU1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC197Q8NCU1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC197Q8NCU1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC197Q8NCU1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC197Q8NCU1 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC197Q8NCU1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC197Q8NCU1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC197Q8NCU1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC197Q8NCU1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC197Q8NCU1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC197Q8NCU1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC197Q8NCU1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC197Q8NCU1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC197Q8NCU1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC197Q8NCU1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC197Q8NCU1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC197Q8NCU1 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC197Q8NCU1 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC197Q8NCU1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC197Q8NCU1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC197Q8NCU1 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC197Q8NCU1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC197Q8NCU1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC197Q8NCU1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC197Q8NCU1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC197Q8NCU1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC197Q8NCU1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC197Q8NCU1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC197Q8NCU1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC197Q8NCU1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC197Q8NCU1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC197Q8NCU1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC197Q8NCU1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC197Q8NCU1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC197Q8NCU1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC197Q8NCU1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC197Q8NCU1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC197Q8NCU1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC197Q8NCU1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC197Q8NCU1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC197Q8NCU1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC197Q8NCU1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC197Q8NCU1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC197Q8NCU1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC197Q8NCU1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC197Q8NCU1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC197Q8NCU1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC197Q8NCU1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC197Q8NCU1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC197Q8NCU1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC197Q8NCU1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms