Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCT1

ARRDC4, Arrestin domain-containing protein 4, humanhuman

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARRDC4Q8NCT1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ARRDC4Q8NCT1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ARRDC4Q8NCT1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ARRDC4Q8NCT1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ARRDC4Q8NCT1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ARRDC4Q8NCT1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ARRDC4Q8NCT1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
ARRDC4Q8NCT1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ARRDC4Q8NCT1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ARRDC4Q8NCT1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ARRDC4Q8NCT1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ARRDC4Q8NCT1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ARRDC4Q8NCT1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ARRDC4Q8NCT1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ARRDC4Q8NCT1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ARRDC4Q8NCT1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ARRDC4Q8NCT1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ARRDC4Q8NCT1 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ARRDC4Q8NCT1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ARRDC4Q8NCT1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29■■■□□ 2.23
ARRDC4Q8NCT1 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ARRDC4Q8NCT1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ARRDC4Q8NCT1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ARRDC4Q8NCT1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ARRDC4Q8NCT1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
ARRDC4Q8NCT1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ARRDC4Q8NCT1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ARRDC4Q8NCT1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ARRDC4Q8NCT1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ARRDC4Q8NCT1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ARRDC4Q8NCT1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ARRDC4Q8NCT1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ARRDC4Q8NCT1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ARRDC4Q8NCT1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ARRDC4Q8NCT1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ARRDC4Q8NCT1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ARRDC4Q8NCT1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ARRDC4Q8NCT1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ARRDC4Q8NCT1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
ARRDC4Q8NCT1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ARRDC4Q8NCT1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
ARRDC4Q8NCT1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
ARRDC4Q8NCT1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ARRDC4Q8NCT1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ARRDC4Q8NCT1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ARRDC4Q8NCT1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
ARRDC4Q8NCT1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ARRDC4Q8NCT1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ARRDC4Q8NCT1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ARRDC4Q8NCT1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ARRDC4Q8NCT1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
ARRDC4Q8NCT1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
ARRDC4Q8NCT1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ARRDC4Q8NCT1 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ARRDC4Q8NCT1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
ARRDC4Q8NCT1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ARRDC4Q8NCT1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ARRDC4Q8NCT1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ARRDC4Q8NCT1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ARRDC4Q8NCT1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ARRDC4Q8NCT1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ARRDC4Q8NCT1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ARRDC4Q8NCT1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
ARRDC4Q8NCT1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ARRDC4Q8NCT1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ARRDC4Q8NCT1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ARRDC4Q8NCT1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ARRDC4Q8NCT1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ARRDC4Q8NCT1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ARRDC4Q8NCT1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ARRDC4Q8NCT1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ARRDC4Q8NCT1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ARRDC4Q8NCT1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ARRDC4Q8NCT1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ARRDC4Q8NCT1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ARRDC4Q8NCT1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
ARRDC4Q8NCT1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ARRDC4Q8NCT1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
ARRDC4Q8NCT1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ARRDC4Q8NCT1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
ARRDC4Q8NCT1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ARRDC4Q8NCT1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ARRDC4Q8NCT1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ARRDC4Q8NCT1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ARRDC4Q8NCT1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ARRDC4Q8NCT1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
ARRDC4Q8NCT1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ARRDC4Q8NCT1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ARRDC4Q8NCT1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ARRDC4Q8NCT1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ARRDC4Q8NCT1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ARRDC4Q8NCT1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ARRDC4Q8NCT1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ARRDC4Q8NCT1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ARRDC4Q8NCT1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
ARRDC4Q8NCT1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ARRDC4Q8NCT1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
ARRDC4Q8NCT1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
ARRDC4Q8NCT1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ARRDC4Q8NCT1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
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