Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBN7

RDH13, Retinol dehydrogenase 13, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH13Q8NBN7 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RDH13Q8NBN7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RDH13Q8NBN7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RDH13Q8NBN7 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
RDH13Q8NBN7 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RDH13Q8NBN7 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RDH13Q8NBN7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RDH13Q8NBN7 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
RDH13Q8NBN7 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RDH13Q8NBN7 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RDH13Q8NBN7 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RDH13Q8NBN7 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RDH13Q8NBN7 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
RDH13Q8NBN7 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RDH13Q8NBN7 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RDH13Q8NBN7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RDH13Q8NBN7 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RDH13Q8NBN7 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RDH13Q8NBN7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RDH13Q8NBN7 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RDH13Q8NBN7 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
RDH13Q8NBN7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RDH13Q8NBN7 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RDH13Q8NBN7 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RDH13Q8NBN7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RDH13Q8NBN7 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RDH13Q8NBN7 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RDH13Q8NBN7 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RDH13Q8NBN7 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RDH13Q8NBN7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RDH13Q8NBN7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RDH13Q8NBN7 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RDH13Q8NBN7 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RDH13Q8NBN7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RDH13Q8NBN7 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RDH13Q8NBN7 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
RDH13Q8NBN7 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RDH13Q8NBN7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RDH13Q8NBN7 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RDH13Q8NBN7 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RDH13Q8NBN7 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RDH13Q8NBN7 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RDH13Q8NBN7 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
RDH13Q8NBN7 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RDH13Q8NBN7 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RDH13Q8NBN7 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RDH13Q8NBN7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RDH13Q8NBN7 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RDH13Q8NBN7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
RDH13Q8NBN7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
RDH13Q8NBN7 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
RDH13Q8NBN7 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RDH13Q8NBN7 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RDH13Q8NBN7 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RDH13Q8NBN7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RDH13Q8NBN7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RDH13Q8NBN7 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RDH13Q8NBN7 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RDH13Q8NBN7 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RDH13Q8NBN7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RDH13Q8NBN7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RDH13Q8NBN7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RDH13Q8NBN7 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RDH13Q8NBN7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RDH13Q8NBN7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RDH13Q8NBN7 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RDH13Q8NBN7 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RDH13Q8NBN7 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
RDH13Q8NBN7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RDH13Q8NBN7 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RDH13Q8NBN7 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RDH13Q8NBN7 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RDH13Q8NBN7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RDH13Q8NBN7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
RDH13Q8NBN7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
RDH13Q8NBN7 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RDH13Q8NBN7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RDH13Q8NBN7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RDH13Q8NBN7 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RDH13Q8NBN7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RDH13Q8NBN7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RDH13Q8NBN7 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RDH13Q8NBN7 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RDH13Q8NBN7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RDH13Q8NBN7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RDH13Q8NBN7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RDH13Q8NBN7 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RDH13Q8NBN7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
RDH13Q8NBN7 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RDH13Q8NBN7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RDH13Q8NBN7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RDH13Q8NBN7 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RDH13Q8NBN7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RDH13Q8NBN7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RDH13Q8NBN7 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
RDH13Q8NBN7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RDH13Q8NBN7 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RDH13Q8NBN7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RDH13Q8NBN7 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RDH13Q8NBN7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms