Protein–RNA interactions for Protein: Q8NB12

SMYD1, Histone-lysine N-methyltransferase SMYD1, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD1Q8NB12 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMYD1Q8NB12 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMYD1Q8NB12 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMYD1Q8NB12 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMYD1Q8NB12 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMYD1Q8NB12 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMYD1Q8NB12 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMYD1Q8NB12 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMYD1Q8NB12 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SMYD1Q8NB12 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMYD1Q8NB12 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMYD1Q8NB12 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMYD1Q8NB12 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMYD1Q8NB12 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMYD1Q8NB12 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMYD1Q8NB12 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMYD1Q8NB12 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMYD1Q8NB12 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMYD1Q8NB12 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SMYD1Q8NB12 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMYD1Q8NB12 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMYD1Q8NB12 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMYD1Q8NB12 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMYD1Q8NB12 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMYD1Q8NB12 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMYD1Q8NB12 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMYD1Q8NB12 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMYD1Q8NB12 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMYD1Q8NB12 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SMYD1Q8NB12 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMYD1Q8NB12 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMYD1Q8NB12 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMYD1Q8NB12 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMYD1Q8NB12 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMYD1Q8NB12 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMYD1Q8NB12 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMYD1Q8NB12 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMYD1Q8NB12 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMYD1Q8NB12 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMYD1Q8NB12 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMYD1Q8NB12 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMYD1Q8NB12 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMYD1Q8NB12 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMYD1Q8NB12 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMYD1Q8NB12 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMYD1Q8NB12 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMYD1Q8NB12 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMYD1Q8NB12 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMYD1Q8NB12 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMYD1Q8NB12 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMYD1Q8NB12 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMYD1Q8NB12 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SMYD1Q8NB12 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMYD1Q8NB12 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMYD1Q8NB12 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMYD1Q8NB12 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMYD1Q8NB12 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMYD1Q8NB12 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMYD1Q8NB12 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMYD1Q8NB12 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMYD1Q8NB12 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMYD1Q8NB12 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMYD1Q8NB12 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMYD1Q8NB12 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMYD1Q8NB12 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMYD1Q8NB12 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMYD1Q8NB12 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMYD1Q8NB12 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMYD1Q8NB12 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMYD1Q8NB12 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMYD1Q8NB12 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMYD1Q8NB12 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMYD1Q8NB12 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMYD1Q8NB12 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMYD1Q8NB12 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMYD1Q8NB12 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMYD1Q8NB12 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMYD1Q8NB12 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMYD1Q8NB12 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMYD1Q8NB12 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMYD1Q8NB12 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMYD1Q8NB12 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMYD1Q8NB12 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMYD1Q8NB12 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMYD1Q8NB12 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMYD1Q8NB12 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMYD1Q8NB12 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMYD1Q8NB12 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMYD1Q8NB12 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMYD1Q8NB12 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMYD1Q8NB12 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMYD1Q8NB12 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SMYD1Q8NB12 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMYD1Q8NB12 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SMYD1Q8NB12 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMYD1Q8NB12 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMYD1Q8NB12 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMYD1Q8NB12 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMYD1Q8NB12 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMYD1Q8NB12 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms