Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8G6

C15orf54, Putative uncharacterized protein C15orf54, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C15orf54Q8N8G6 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
C15orf54Q8N8G6 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
C15orf54Q8N8G6 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
C15orf54Q8N8G6 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
C15orf54Q8N8G6 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
C15orf54Q8N8G6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
C15orf54Q8N8G6 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
C15orf54Q8N8G6 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
C15orf54Q8N8G6 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
C15orf54Q8N8G6 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
C15orf54Q8N8G6 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
C15orf54Q8N8G6 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
C15orf54Q8N8G6 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
C15orf54Q8N8G6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
C15orf54Q8N8G6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C15orf54Q8N8G6 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C15orf54Q8N8G6 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
C15orf54Q8N8G6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
C15orf54Q8N8G6 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
C15orf54Q8N8G6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
C15orf54Q8N8G6 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
C15orf54Q8N8G6 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
C15orf54Q8N8G6 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
C15orf54Q8N8G6 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
C15orf54Q8N8G6 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
C15orf54Q8N8G6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
C15orf54Q8N8G6 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
C15orf54Q8N8G6 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
C15orf54Q8N8G6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C15orf54Q8N8G6 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C15orf54Q8N8G6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
C15orf54Q8N8G6 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C15orf54Q8N8G6 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
C15orf54Q8N8G6 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C15orf54Q8N8G6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C15orf54Q8N8G6 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
C15orf54Q8N8G6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C15orf54Q8N8G6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C15orf54Q8N8G6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C15orf54Q8N8G6 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C15orf54Q8N8G6 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C15orf54Q8N8G6 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C15orf54Q8N8G6 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C15orf54Q8N8G6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C15orf54Q8N8G6 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C15orf54Q8N8G6 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C15orf54Q8N8G6 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C15orf54Q8N8G6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
C15orf54Q8N8G6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
C15orf54Q8N8G6 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C15orf54Q8N8G6 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C15orf54Q8N8G6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C15orf54Q8N8G6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C15orf54Q8N8G6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C15orf54Q8N8G6 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C15orf54Q8N8G6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C15orf54Q8N8G6 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C15orf54Q8N8G6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C15orf54Q8N8G6 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C15orf54Q8N8G6 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C15orf54Q8N8G6 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C15orf54Q8N8G6 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C15orf54Q8N8G6 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C15orf54Q8N8G6 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C15orf54Q8N8G6 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C15orf54Q8N8G6 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C15orf54Q8N8G6 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C15orf54Q8N8G6 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
C15orf54Q8N8G6 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C15orf54Q8N8G6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
C15orf54Q8N8G6 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C15orf54Q8N8G6 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
C15orf54Q8N8G6 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C15orf54Q8N8G6 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C15orf54Q8N8G6 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
C15orf54Q8N8G6 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C15orf54Q8N8G6 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
C15orf54Q8N8G6 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C15orf54Q8N8G6 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C15orf54Q8N8G6 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C15orf54Q8N8G6 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C15orf54Q8N8G6 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C15orf54Q8N8G6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C15orf54Q8N8G6 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C15orf54Q8N8G6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C15orf54Q8N8G6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C15orf54Q8N8G6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C15orf54Q8N8G6 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
C15orf54Q8N8G6 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C15orf54Q8N8G6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
C15orf54Q8N8G6 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C15orf54Q8N8G6 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C15orf54Q8N8G6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C15orf54Q8N8G6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C15orf54Q8N8G6 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C15orf54Q8N8G6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C15orf54Q8N8G6 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C15orf54Q8N8G6 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
C15orf54Q8N8G6 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
C15orf54Q8N8G6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms