Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7R0

NANOGP1, Putative homeobox protein NANOG2, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP1Q8N7R0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NANOGP1Q8N7R0 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NANOGP1Q8N7R0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NANOGP1Q8N7R0 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NANOGP1Q8N7R0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NANOGP1Q8N7R0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NANOGP1Q8N7R0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NANOGP1Q8N7R0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NANOGP1Q8N7R0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NANOGP1Q8N7R0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NANOGP1Q8N7R0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NANOGP1Q8N7R0 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NANOGP1Q8N7R0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NANOGP1Q8N7R0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NANOGP1Q8N7R0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NANOGP1Q8N7R0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NANOGP1Q8N7R0 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NANOGP1Q8N7R0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NANOGP1Q8N7R0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NANOGP1Q8N7R0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NANOGP1Q8N7R0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NANOGP1Q8N7R0 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NANOGP1Q8N7R0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NANOGP1Q8N7R0 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NANOGP1Q8N7R0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NANOGP1Q8N7R0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NANOGP1Q8N7R0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NANOGP1Q8N7R0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NANOGP1Q8N7R0 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NANOGP1Q8N7R0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NANOGP1Q8N7R0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NANOGP1Q8N7R0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NANOGP1Q8N7R0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NANOGP1Q8N7R0 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NANOGP1Q8N7R0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NANOGP1Q8N7R0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NANOGP1Q8N7R0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NANOGP1Q8N7R0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NANOGP1Q8N7R0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NANOGP1Q8N7R0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NANOGP1Q8N7R0 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NANOGP1Q8N7R0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NANOGP1Q8N7R0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NANOGP1Q8N7R0 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NANOGP1Q8N7R0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NANOGP1Q8N7R0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NANOGP1Q8N7R0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NANOGP1Q8N7R0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NANOGP1Q8N7R0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NANOGP1Q8N7R0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NANOGP1Q8N7R0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NANOGP1Q8N7R0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NANOGP1Q8N7R0 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NANOGP1Q8N7R0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NANOGP1Q8N7R0 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NANOGP1Q8N7R0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NANOGP1Q8N7R0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NANOGP1Q8N7R0 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NANOGP1Q8N7R0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NANOGP1Q8N7R0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NANOGP1Q8N7R0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NANOGP1Q8N7R0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NANOGP1Q8N7R0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NANOGP1Q8N7R0 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NANOGP1Q8N7R0 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NANOGP1Q8N7R0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NANOGP1Q8N7R0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NANOGP1Q8N7R0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NANOGP1Q8N7R0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NANOGP1Q8N7R0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NANOGP1Q8N7R0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NANOGP1Q8N7R0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NANOGP1Q8N7R0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NANOGP1Q8N7R0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NANOGP1Q8N7R0 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NANOGP1Q8N7R0 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NANOGP1Q8N7R0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NANOGP1Q8N7R0 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NANOGP1Q8N7R0 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NANOGP1Q8N7R0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NANOGP1Q8N7R0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NANOGP1Q8N7R0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NANOGP1Q8N7R0 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NANOGP1Q8N7R0 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NANOGP1Q8N7R0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NANOGP1Q8N7R0 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NANOGP1Q8N7R0 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NANOGP1Q8N7R0 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NANOGP1Q8N7R0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NANOGP1Q8N7R0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NANOGP1Q8N7R0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NANOGP1Q8N7R0 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NANOGP1Q8N7R0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NANOGP1Q8N7R0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NANOGP1Q8N7R0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NANOGP1Q8N7R0 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NANOGP1Q8N7R0 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NANOGP1Q8N7R0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NANOGP1Q8N7R0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NANOGP1Q8N7R0 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms