Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4V2

SVOP, Synaptic vesicle 2-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVOPQ8N4V2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SVOPQ8N4V2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SVOPQ8N4V2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SVOPQ8N4V2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SVOPQ8N4V2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SVOPQ8N4V2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SVOPQ8N4V2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SVOPQ8N4V2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SVOPQ8N4V2 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SVOPQ8N4V2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SVOPQ8N4V2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SVOPQ8N4V2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SVOPQ8N4V2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SVOPQ8N4V2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SVOPQ8N4V2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SVOPQ8N4V2 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SVOPQ8N4V2 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SVOPQ8N4V2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SVOPQ8N4V2 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SVOPQ8N4V2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SVOPQ8N4V2 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SVOPQ8N4V2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SVOPQ8N4V2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SVOPQ8N4V2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SVOPQ8N4V2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SVOPQ8N4V2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SVOPQ8N4V2 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SVOPQ8N4V2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SVOPQ8N4V2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SVOPQ8N4V2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SVOPQ8N4V2 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SVOPQ8N4V2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SVOPQ8N4V2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SVOPQ8N4V2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SVOPQ8N4V2 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SVOPQ8N4V2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SVOPQ8N4V2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SVOPQ8N4V2 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SVOPQ8N4V2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SVOPQ8N4V2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SVOPQ8N4V2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SVOPQ8N4V2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SVOPQ8N4V2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SVOPQ8N4V2 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SVOPQ8N4V2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SVOPQ8N4V2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SVOPQ8N4V2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SVOPQ8N4V2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SVOPQ8N4V2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SVOPQ8N4V2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SVOPQ8N4V2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SVOPQ8N4V2 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SVOPQ8N4V2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SVOPQ8N4V2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SVOPQ8N4V2 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SVOPQ8N4V2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SVOPQ8N4V2 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SVOPQ8N4V2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SVOPQ8N4V2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SVOPQ8N4V2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SVOPQ8N4V2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SVOPQ8N4V2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SVOPQ8N4V2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SVOPQ8N4V2 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SVOPQ8N4V2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SVOPQ8N4V2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SVOPQ8N4V2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SVOPQ8N4V2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SVOPQ8N4V2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SVOPQ8N4V2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SVOPQ8N4V2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SVOPQ8N4V2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SVOPQ8N4V2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SVOPQ8N4V2 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SVOPQ8N4V2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SVOPQ8N4V2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SVOPQ8N4V2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SVOPQ8N4V2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SVOPQ8N4V2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SVOPQ8N4V2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SVOPQ8N4V2 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SVOPQ8N4V2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SVOPQ8N4V2 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SVOPQ8N4V2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SVOPQ8N4V2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SVOPQ8N4V2 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SVOPQ8N4V2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SVOPQ8N4V2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SVOPQ8N4V2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SVOPQ8N4V2 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SVOPQ8N4V2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SVOPQ8N4V2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SVOPQ8N4V2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SVOPQ8N4V2 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SVOPQ8N4V2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SVOPQ8N4V2 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SVOPQ8N4V2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SVOPQ8N4V2 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SVOPQ8N4V2 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SVOPQ8N4V2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.5 ms