Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3Y7

SDR16C5, Epidermal retinol dehydrogenase 2, humanhuman

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDR16C5Q8N3Y7 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SDR16C5Q8N3Y7 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SDR16C5Q8N3Y7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SDR16C5Q8N3Y7 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SDR16C5Q8N3Y7 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SDR16C5Q8N3Y7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SDR16C5Q8N3Y7 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SDR16C5Q8N3Y7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SDR16C5Q8N3Y7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SDR16C5Q8N3Y7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SDR16C5Q8N3Y7 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SDR16C5Q8N3Y7 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SDR16C5Q8N3Y7 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SDR16C5Q8N3Y7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SDR16C5Q8N3Y7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SDR16C5Q8N3Y7 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SDR16C5Q8N3Y7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SDR16C5Q8N3Y7 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SDR16C5Q8N3Y7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SDR16C5Q8N3Y7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SDR16C5Q8N3Y7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SDR16C5Q8N3Y7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SDR16C5Q8N3Y7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SDR16C5Q8N3Y7 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SDR16C5Q8N3Y7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SDR16C5Q8N3Y7 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SDR16C5Q8N3Y7 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SDR16C5Q8N3Y7 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SDR16C5Q8N3Y7 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SDR16C5Q8N3Y7 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SDR16C5Q8N3Y7 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SDR16C5Q8N3Y7 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SDR16C5Q8N3Y7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SDR16C5Q8N3Y7 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SDR16C5Q8N3Y7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SDR16C5Q8N3Y7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SDR16C5Q8N3Y7 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SDR16C5Q8N3Y7 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SDR16C5Q8N3Y7 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SDR16C5Q8N3Y7 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SDR16C5Q8N3Y7 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SDR16C5Q8N3Y7 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SDR16C5Q8N3Y7 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SDR16C5Q8N3Y7 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SDR16C5Q8N3Y7 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SDR16C5Q8N3Y7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SDR16C5Q8N3Y7 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SDR16C5Q8N3Y7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SDR16C5Q8N3Y7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SDR16C5Q8N3Y7 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SDR16C5Q8N3Y7 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SDR16C5Q8N3Y7 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SDR16C5Q8N3Y7 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SDR16C5Q8N3Y7 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SDR16C5Q8N3Y7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SDR16C5Q8N3Y7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SDR16C5Q8N3Y7 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SDR16C5Q8N3Y7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SDR16C5Q8N3Y7 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SDR16C5Q8N3Y7 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SDR16C5Q8N3Y7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SDR16C5Q8N3Y7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SDR16C5Q8N3Y7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SDR16C5Q8N3Y7 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SDR16C5Q8N3Y7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SDR16C5Q8N3Y7 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SDR16C5Q8N3Y7 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SDR16C5Q8N3Y7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SDR16C5Q8N3Y7 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SDR16C5Q8N3Y7 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SDR16C5Q8N3Y7 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SDR16C5Q8N3Y7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SDR16C5Q8N3Y7 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SDR16C5Q8N3Y7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
SDR16C5Q8N3Y7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SDR16C5Q8N3Y7 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SDR16C5Q8N3Y7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SDR16C5Q8N3Y7 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SDR16C5Q8N3Y7 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SDR16C5Q8N3Y7 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SDR16C5Q8N3Y7 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SDR16C5Q8N3Y7 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SDR16C5Q8N3Y7 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SDR16C5Q8N3Y7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SDR16C5Q8N3Y7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SDR16C5Q8N3Y7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SDR16C5Q8N3Y7 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SDR16C5Q8N3Y7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SDR16C5Q8N3Y7 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SDR16C5Q8N3Y7 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SDR16C5Q8N3Y7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SDR16C5Q8N3Y7 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SDR16C5Q8N3Y7 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SDR16C5Q8N3Y7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SDR16C5Q8N3Y7 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SDR16C5Q8N3Y7 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SDR16C5Q8N3Y7 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SDR16C5Q8N3Y7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SDR16C5Q8N3Y7 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SDR16C5Q8N3Y7 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
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