Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXH7

NELFCD, Negative elongation factor C/D, humanhuman

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFCDQ8IXH7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NELFCDQ8IXH7 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NELFCDQ8IXH7 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
NELFCDQ8IXH7 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NELFCDQ8IXH7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NELFCDQ8IXH7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NELFCDQ8IXH7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NELFCDQ8IXH7 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
NELFCDQ8IXH7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NELFCDQ8IXH7 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NELFCDQ8IXH7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
NELFCDQ8IXH7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NELFCDQ8IXH7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NELFCDQ8IXH7 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NELFCDQ8IXH7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NELFCDQ8IXH7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NELFCDQ8IXH7 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NELFCDQ8IXH7 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NELFCDQ8IXH7 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NELFCDQ8IXH7 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NELFCDQ8IXH7 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NELFCDQ8IXH7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NELFCDQ8IXH7 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NELFCDQ8IXH7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NELFCDQ8IXH7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NELFCDQ8IXH7 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
NELFCDQ8IXH7 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
NELFCDQ8IXH7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
NELFCDQ8IXH7 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NELFCDQ8IXH7 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NELFCDQ8IXH7 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NELFCDQ8IXH7 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NELFCDQ8IXH7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NELFCDQ8IXH7 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NELFCDQ8IXH7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NELFCDQ8IXH7 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NELFCDQ8IXH7 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NELFCDQ8IXH7 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NELFCDQ8IXH7 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NELFCDQ8IXH7 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NELFCDQ8IXH7 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
NELFCDQ8IXH7 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NELFCDQ8IXH7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NELFCDQ8IXH7 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NELFCDQ8IXH7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NELFCDQ8IXH7 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NELFCDQ8IXH7 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NELFCDQ8IXH7 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NELFCDQ8IXH7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NELFCDQ8IXH7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NELFCDQ8IXH7 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NELFCDQ8IXH7 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NELFCDQ8IXH7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
NELFCDQ8IXH7 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NELFCDQ8IXH7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NELFCDQ8IXH7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NELFCDQ8IXH7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NELFCDQ8IXH7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NELFCDQ8IXH7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NELFCDQ8IXH7 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NELFCDQ8IXH7 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NELFCDQ8IXH7 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NELFCDQ8IXH7 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NELFCDQ8IXH7 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NELFCDQ8IXH7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NELFCDQ8IXH7 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NELFCDQ8IXH7 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NELFCDQ8IXH7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NELFCDQ8IXH7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NELFCDQ8IXH7 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NELFCDQ8IXH7 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NELFCDQ8IXH7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NELFCDQ8IXH7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NELFCDQ8IXH7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NELFCDQ8IXH7 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NELFCDQ8IXH7 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
NELFCDQ8IXH7 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NELFCDQ8IXH7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NELFCDQ8IXH7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
NELFCDQ8IXH7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NELFCDQ8IXH7 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NELFCDQ8IXH7 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NELFCDQ8IXH7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NELFCDQ8IXH7 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NELFCDQ8IXH7 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NELFCDQ8IXH7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NELFCDQ8IXH7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NELFCDQ8IXH7 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NELFCDQ8IXH7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NELFCDQ8IXH7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NELFCDQ8IXH7 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NELFCDQ8IXH7 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NELFCDQ8IXH7 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NELFCDQ8IXH7 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NELFCDQ8IXH7 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NELFCDQ8IXH7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NELFCDQ8IXH7 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NELFCDQ8IXH7 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NELFCDQ8IXH7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NELFCDQ8IXH7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.6 ms