Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUH8

SPPL2C, Signal peptide peptidase-like 2C, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPPL2CQ8IUH8 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SPPL2CQ8IUH8 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPPL2CQ8IUH8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPPL2CQ8IUH8 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPPL2CQ8IUH8 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPPL2CQ8IUH8 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPPL2CQ8IUH8 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPPL2CQ8IUH8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPPL2CQ8IUH8 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPPL2CQ8IUH8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPPL2CQ8IUH8 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPPL2CQ8IUH8 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPPL2CQ8IUH8 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPPL2CQ8IUH8 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPPL2CQ8IUH8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPPL2CQ8IUH8 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPPL2CQ8IUH8 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPPL2CQ8IUH8 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPPL2CQ8IUH8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPPL2CQ8IUH8 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPPL2CQ8IUH8 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPPL2CQ8IUH8 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPPL2CQ8IUH8 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPPL2CQ8IUH8 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPPL2CQ8IUH8 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPPL2CQ8IUH8 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPPL2CQ8IUH8 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPPL2CQ8IUH8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPPL2CQ8IUH8 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPPL2CQ8IUH8 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPPL2CQ8IUH8 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPPL2CQ8IUH8 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPPL2CQ8IUH8 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPPL2CQ8IUH8 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPPL2CQ8IUH8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPPL2CQ8IUH8 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPPL2CQ8IUH8 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPPL2CQ8IUH8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPPL2CQ8IUH8 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPPL2CQ8IUH8 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPPL2CQ8IUH8 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPPL2CQ8IUH8 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPPL2CQ8IUH8 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPPL2CQ8IUH8 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPPL2CQ8IUH8 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPPL2CQ8IUH8 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPPL2CQ8IUH8 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPPL2CQ8IUH8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPPL2CQ8IUH8 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPPL2CQ8IUH8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPPL2CQ8IUH8 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPPL2CQ8IUH8 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPPL2CQ8IUH8 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPPL2CQ8IUH8 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SPPL2CQ8IUH8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPPL2CQ8IUH8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPPL2CQ8IUH8 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPPL2CQ8IUH8 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPPL2CQ8IUH8 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPPL2CQ8IUH8 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPPL2CQ8IUH8 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPPL2CQ8IUH8 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPPL2CQ8IUH8 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPPL2CQ8IUH8 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPPL2CQ8IUH8 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPPL2CQ8IUH8 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPPL2CQ8IUH8 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPPL2CQ8IUH8 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPPL2CQ8IUH8 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPPL2CQ8IUH8 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPPL2CQ8IUH8 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPPL2CQ8IUH8 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPPL2CQ8IUH8 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPPL2CQ8IUH8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SPPL2CQ8IUH8 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPPL2CQ8IUH8 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPPL2CQ8IUH8 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPPL2CQ8IUH8 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPPL2CQ8IUH8 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SPPL2CQ8IUH8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPPL2CQ8IUH8 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SPPL2CQ8IUH8 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SPPL2CQ8IUH8 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SPPL2CQ8IUH8 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPPL2CQ8IUH8 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SPPL2CQ8IUH8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPPL2CQ8IUH8 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPPL2CQ8IUH8 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPPL2CQ8IUH8 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPPL2CQ8IUH8 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPPL2CQ8IUH8 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPPL2CQ8IUH8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPPL2CQ8IUH8 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPPL2CQ8IUH8 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPPL2CQ8IUH8 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPPL2CQ8IUH8 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPPL2CQ8IUH8 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPPL2CQ8IUH8 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPPL2CQ8IUH8 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPPL2CQ8IUH8 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms