Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUG1

KRTAP1-3, Keratin-associated protein 1-3, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-3Q8IUG1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KRTAP1-3Q8IUG1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KRTAP1-3Q8IUG1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KRTAP1-3Q8IUG1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KRTAP1-3Q8IUG1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
KRTAP1-3Q8IUG1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KRTAP1-3Q8IUG1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KRTAP1-3Q8IUG1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KRTAP1-3Q8IUG1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KRTAP1-3Q8IUG1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KRTAP1-3Q8IUG1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KRTAP1-3Q8IUG1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KRTAP1-3Q8IUG1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KRTAP1-3Q8IUG1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KRTAP1-3Q8IUG1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KRTAP1-3Q8IUG1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KRTAP1-3Q8IUG1 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KRTAP1-3Q8IUG1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KRTAP1-3Q8IUG1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KRTAP1-3Q8IUG1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
KRTAP1-3Q8IUG1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KRTAP1-3Q8IUG1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KRTAP1-3Q8IUG1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KRTAP1-3Q8IUG1 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KRTAP1-3Q8IUG1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KRTAP1-3Q8IUG1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
KRTAP1-3Q8IUG1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KRTAP1-3Q8IUG1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KRTAP1-3Q8IUG1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
KRTAP1-3Q8IUG1 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
KRTAP1-3Q8IUG1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KRTAP1-3Q8IUG1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KRTAP1-3Q8IUG1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KRTAP1-3Q8IUG1 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KRTAP1-3Q8IUG1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
KRTAP1-3Q8IUG1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
KRTAP1-3Q8IUG1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KRTAP1-3Q8IUG1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KRTAP1-3Q8IUG1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KRTAP1-3Q8IUG1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KRTAP1-3Q8IUG1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KRTAP1-3Q8IUG1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
KRTAP1-3Q8IUG1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KRTAP1-3Q8IUG1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KRTAP1-3Q8IUG1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
KRTAP1-3Q8IUG1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KRTAP1-3Q8IUG1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KRTAP1-3Q8IUG1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
KRTAP1-3Q8IUG1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRTAP1-3Q8IUG1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRTAP1-3Q8IUG1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
KRTAP1-3Q8IUG1 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRTAP1-3Q8IUG1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRTAP1-3Q8IUG1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRTAP1-3Q8IUG1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KRTAP1-3Q8IUG1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRTAP1-3Q8IUG1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRTAP1-3Q8IUG1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRTAP1-3Q8IUG1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRTAP1-3Q8IUG1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KRTAP1-3Q8IUG1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KRTAP1-3Q8IUG1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
KRTAP1-3Q8IUG1 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KRTAP1-3Q8IUG1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KRTAP1-3Q8IUG1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KRTAP1-3Q8IUG1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
KRTAP1-3Q8IUG1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KRTAP1-3Q8IUG1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
KRTAP1-3Q8IUG1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
KRTAP1-3Q8IUG1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KRTAP1-3Q8IUG1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
KRTAP1-3Q8IUG1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRTAP1-3Q8IUG1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRTAP1-3Q8IUG1 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRTAP1-3Q8IUG1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRTAP1-3Q8IUG1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRTAP1-3Q8IUG1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRTAP1-3Q8IUG1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KRTAP1-3Q8IUG1 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KRTAP1-3Q8IUG1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KRTAP1-3Q8IUG1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KRTAP1-3Q8IUG1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KRTAP1-3Q8IUG1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KRTAP1-3Q8IUG1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KRTAP1-3Q8IUG1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KRTAP1-3Q8IUG1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KRTAP1-3Q8IUG1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KRTAP1-3Q8IUG1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
KRTAP1-3Q8IUG1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KRTAP1-3Q8IUG1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KRTAP1-3Q8IUG1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
KRTAP1-3Q8IUG1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KRTAP1-3Q8IUG1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KRTAP1-3Q8IUG1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KRTAP1-3Q8IUG1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KRTAP1-3Q8IUG1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KRTAP1-3Q8IUG1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KRTAP1-3Q8IUG1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KRTAP1-3Q8IUG1 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KRTAP1-3Q8IUG1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms