Protein–RNA interactions for Protein: Q86VP3

PACS2, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS2Q86VP3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PACS2Q86VP3 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PACS2Q86VP3 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PACS2Q86VP3 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PACS2Q86VP3 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PACS2Q86VP3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
PACS2Q86VP3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PACS2Q86VP3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PACS2Q86VP3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PACS2Q86VP3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PACS2Q86VP3 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PACS2Q86VP3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PACS2Q86VP3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PACS2Q86VP3 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PACS2Q86VP3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PACS2Q86VP3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PACS2Q86VP3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PACS2Q86VP3 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PACS2Q86VP3 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PACS2Q86VP3 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PACS2Q86VP3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PACS2Q86VP3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PACS2Q86VP3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PACS2Q86VP3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PACS2Q86VP3 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PACS2Q86VP3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PACS2Q86VP3 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PACS2Q86VP3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PACS2Q86VP3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PACS2Q86VP3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PACS2Q86VP3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PACS2Q86VP3 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PACS2Q86VP3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PACS2Q86VP3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PACS2Q86VP3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PACS2Q86VP3 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PACS2Q86VP3 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PACS2Q86VP3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PACS2Q86VP3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PACS2Q86VP3 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PACS2Q86VP3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PACS2Q86VP3 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PACS2Q86VP3 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PACS2Q86VP3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PACS2Q86VP3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PACS2Q86VP3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PACS2Q86VP3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PACS2Q86VP3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PACS2Q86VP3 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PACS2Q86VP3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PACS2Q86VP3 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PACS2Q86VP3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PACS2Q86VP3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PACS2Q86VP3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PACS2Q86VP3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PACS2Q86VP3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PACS2Q86VP3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PACS2Q86VP3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PACS2Q86VP3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PACS2Q86VP3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PACS2Q86VP3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PACS2Q86VP3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PACS2Q86VP3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PACS2Q86VP3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PACS2Q86VP3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PACS2Q86VP3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PACS2Q86VP3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PACS2Q86VP3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PACS2Q86VP3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PACS2Q86VP3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PACS2Q86VP3 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PACS2Q86VP3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PACS2Q86VP3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PACS2Q86VP3 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PACS2Q86VP3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PACS2Q86VP3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PACS2Q86VP3 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PACS2Q86VP3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PACS2Q86VP3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PACS2Q86VP3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PACS2Q86VP3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PACS2Q86VP3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PACS2Q86VP3 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PACS2Q86VP3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PACS2Q86VP3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PACS2Q86VP3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PACS2Q86VP3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PACS2Q86VP3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PACS2Q86VP3 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PACS2Q86VP3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PACS2Q86VP3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PACS2Q86VP3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PACS2Q86VP3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PACS2Q86VP3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PACS2Q86VP3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PACS2Q86VP3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PACS2Q86VP3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PACS2Q86VP3 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PACS2Q86VP3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PACS2Q86VP3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.7 ms