Protein–RNA interactions for Protein: Q86V81

ALYREF, THO complex subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREFQ86V81 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ALYREFQ86V81 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ALYREFQ86V81 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ALYREFQ86V81 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ALYREFQ86V81 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ALYREFQ86V81 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ALYREFQ86V81 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ALYREFQ86V81 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ALYREFQ86V81 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ALYREFQ86V81 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ALYREFQ86V81 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ALYREFQ86V81 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ALYREFQ86V81 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
ALYREFQ86V81 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ALYREFQ86V81 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ALYREFQ86V81 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ALYREFQ86V81 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ALYREFQ86V81 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
ALYREFQ86V81 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ALYREFQ86V81 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ALYREFQ86V81 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ALYREFQ86V81 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ALYREFQ86V81 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ALYREFQ86V81 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ALYREFQ86V81 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ALYREFQ86V81 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ALYREFQ86V81 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ALYREFQ86V81 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ALYREFQ86V81 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ALYREFQ86V81 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ALYREFQ86V81 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
ALYREFQ86V81 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ALYREFQ86V81 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
ALYREFQ86V81 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ALYREFQ86V81 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ALYREFQ86V81 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ALYREFQ86V81 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ALYREFQ86V81 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ALYREFQ86V81 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ALYREFQ86V81 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ALYREFQ86V81 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ALYREFQ86V81 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ALYREFQ86V81 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ALYREFQ86V81 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
ALYREFQ86V81 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
ALYREFQ86V81 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ALYREFQ86V81 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ALYREFQ86V81 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ALYREFQ86V81 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ALYREFQ86V81 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ALYREFQ86V81 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
ALYREFQ86V81 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ALYREFQ86V81 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ALYREFQ86V81 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ALYREFQ86V81 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ALYREFQ86V81 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ALYREFQ86V81 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ALYREFQ86V81 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ALYREFQ86V81 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ALYREFQ86V81 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ALYREFQ86V81 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ALYREFQ86V81 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ALYREFQ86V81 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ALYREFQ86V81 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ALYREFQ86V81 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ALYREFQ86V81 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
ALYREFQ86V81 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
ALYREFQ86V81 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ALYREFQ86V81 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ALYREFQ86V81 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ALYREFQ86V81 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ALYREFQ86V81 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ALYREFQ86V81 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ALYREFQ86V81 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ALYREFQ86V81 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ALYREFQ86V81 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ALYREFQ86V81 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ALYREFQ86V81 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ALYREFQ86V81 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ALYREFQ86V81 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ALYREFQ86V81 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ALYREFQ86V81 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ALYREFQ86V81 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ALYREFQ86V81 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.84
ALYREFQ86V81 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ALYREFQ86V81 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ALYREFQ86V81 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ALYREFQ86V81 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ALYREFQ86V81 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
ALYREFQ86V81 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ALYREFQ86V81 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ALYREFQ86V81 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ALYREFQ86V81 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ALYREFQ86V81 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ALYREFQ86V81 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ALYREFQ86V81 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ALYREFQ86V81 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ALYREFQ86V81 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ALYREFQ86V81 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ALYREFQ86V81 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.3 ms