Protein–RNA interactions for Protein: Q86UW1

SLC51A, Organic solute transporter subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC51AQ86UW1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.72
SLC51AQ86UW1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
SLC51AQ86UW1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
SLC51AQ86UW1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
SLC51AQ86UW1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
SLC51AQ86UW1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
SLC51AQ86UW1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
SLC51AQ86UW1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
SLC51AQ86UW1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
SLC51AQ86UW1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
SLC51AQ86UW1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
SLC51AQ86UW1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
SLC51AQ86UW1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
SLC51AQ86UW1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
SLC51AQ86UW1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
SLC51AQ86UW1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
SLC51AQ86UW1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
SLC51AQ86UW1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
SLC51AQ86UW1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.71
SLC51AQ86UW1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
SLC51AQ86UW1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
SLC51AQ86UW1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
SLC51AQ86UW1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
SLC51AQ86UW1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
SLC51AQ86UW1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
SLC51AQ86UW1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
SLC51AQ86UW1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
SLC51AQ86UW1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC31.93■■■□□ 2.7
SLC51AQ86UW1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.93■■■□□ 2.7
SLC51AQ86UW1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
SLC51AQ86UW1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
SLC51AQ86UW1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC31.91■■■□□ 2.7
SLC51AQ86UW1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
SLC51AQ86UW1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
SLC51AQ86UW1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
SLC51AQ86UW1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
SLC51AQ86UW1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
SLC51AQ86UW1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
SLC51AQ86UW1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
SLC51AQ86UW1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC31.88■■■□□ 2.69
SLC51AQ86UW1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
SLC51AQ86UW1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC31.86■■■□□ 2.69
SLC51AQ86UW1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC31.85■■■□□ 2.69
SLC51AQ86UW1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
SLC51AQ86UW1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
SLC51AQ86UW1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
SLC51AQ86UW1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
SLC51AQ86UW1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
SLC51AQ86UW1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC31.84■■■□□ 2.69
SLC51AQ86UW1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
SLC51AQ86UW1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
SLC51AQ86UW1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
SLC51AQ86UW1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
SLC51AQ86UW1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
SLC51AQ86UW1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
SLC51AQ86UW1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
SLC51AQ86UW1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC31.82■■■□□ 2.68
SLC51AQ86UW1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
SLC51AQ86UW1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
SLC51AQ86UW1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
SLC51AQ86UW1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.81■■■□□ 2.68
SLC51AQ86UW1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
SLC51AQ86UW1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
SLC51AQ86UW1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
SLC51AQ86UW1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
SLC51AQ86UW1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
SLC51AQ86UW1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
SLC51AQ86UW1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC31.77■■■□□ 2.68
SLC51AQ86UW1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
SLC51AQ86UW1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC31.77■■■□□ 2.68
SLC51AQ86UW1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC31.75■■■□□ 2.67
SLC51AQ86UW1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
SLC51AQ86UW1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC31.74■■■□□ 2.67
SLC51AQ86UW1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
SLC51AQ86UW1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC31.73■■■□□ 2.67
SLC51AQ86UW1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
SLC51AQ86UW1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
SLC51AQ86UW1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
SLC51AQ86UW1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
SLC51AQ86UW1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
SLC51AQ86UW1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
SLC51AQ86UW1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
SLC51AQ86UW1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
SLC51AQ86UW1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC31.7■■■□□ 2.67
SLC51AQ86UW1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
SLC51AQ86UW1 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
SLC51AQ86UW1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
SLC51AQ86UW1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
SLC51AQ86UW1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
SLC51AQ86UW1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
SLC51AQ86UW1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
SLC51AQ86UW1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
SLC51AQ86UW1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC31.67■■■□□ 2.66
SLC51AQ86UW1 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
SLC51AQ86UW1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
SLC51AQ86UW1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
SLC51AQ86UW1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
SLC51AQ86UW1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
SLC51AQ86UW1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
SLC51AQ86UW1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.5 ms