Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z6W1

TMCO2, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO2Q7Z6W1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TMCO2Q7Z6W1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TMCO2Q7Z6W1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TMCO2Q7Z6W1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TMCO2Q7Z6W1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TMCO2Q7Z6W1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
TMCO2Q7Z6W1 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TMCO2Q7Z6W1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TMCO2Q7Z6W1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TMCO2Q7Z6W1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TMCO2Q7Z6W1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.08■■■□□ 2.08
TMCO2Q7Z6W1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TMCO2Q7Z6W1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
TMCO2Q7Z6W1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TMCO2Q7Z6W1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TMCO2Q7Z6W1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TMCO2Q7Z6W1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TMCO2Q7Z6W1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TMCO2Q7Z6W1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TMCO2Q7Z6W1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TMCO2Q7Z6W1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TMCO2Q7Z6W1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TMCO2Q7Z6W1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TMCO2Q7Z6W1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TMCO2Q7Z6W1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TMCO2Q7Z6W1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TMCO2Q7Z6W1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
TMCO2Q7Z6W1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
TMCO2Q7Z6W1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TMCO2Q7Z6W1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TMCO2Q7Z6W1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TMCO2Q7Z6W1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TMCO2Q7Z6W1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TMCO2Q7Z6W1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TMCO2Q7Z6W1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TMCO2Q7Z6W1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TMCO2Q7Z6W1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TMCO2Q7Z6W1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TMCO2Q7Z6W1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TMCO2Q7Z6W1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TMCO2Q7Z6W1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TMCO2Q7Z6W1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TMCO2Q7Z6W1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
TMCO2Q7Z6W1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TMCO2Q7Z6W1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TMCO2Q7Z6W1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TMCO2Q7Z6W1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TMCO2Q7Z6W1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TMCO2Q7Z6W1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TMCO2Q7Z6W1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TMCO2Q7Z6W1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TMCO2Q7Z6W1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TMCO2Q7Z6W1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
TMCO2Q7Z6W1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TMCO2Q7Z6W1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TMCO2Q7Z6W1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TMCO2Q7Z6W1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TMCO2Q7Z6W1 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TMCO2Q7Z6W1 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TMCO2Q7Z6W1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TMCO2Q7Z6W1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TMCO2Q7Z6W1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TMCO2Q7Z6W1 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TMCO2Q7Z6W1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TMCO2Q7Z6W1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TMCO2Q7Z6W1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TMCO2Q7Z6W1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TMCO2Q7Z6W1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TMCO2Q7Z6W1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
TMCO2Q7Z6W1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TMCO2Q7Z6W1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TMCO2Q7Z6W1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
TMCO2Q7Z6W1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
TMCO2Q7Z6W1 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TMCO2Q7Z6W1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TMCO2Q7Z6W1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TMCO2Q7Z6W1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TMCO2Q7Z6W1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TMCO2Q7Z6W1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
TMCO2Q7Z6W1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TMCO2Q7Z6W1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TMCO2Q7Z6W1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TMCO2Q7Z6W1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TMCO2Q7Z6W1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TMCO2Q7Z6W1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TMCO2Q7Z6W1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
TMCO2Q7Z6W1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TMCO2Q7Z6W1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TMCO2Q7Z6W1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
TMCO2Q7Z6W1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TMCO2Q7Z6W1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
TMCO2Q7Z6W1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TMCO2Q7Z6W1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TMCO2Q7Z6W1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TMCO2Q7Z6W1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TMCO2Q7Z6W1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TMCO2Q7Z6W1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
TMCO2Q7Z6W1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TMCO2Q7Z6W1 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TMCO2Q7Z6W1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms