Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z4V0

ZNF438, Zinc finger protein 438, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF438Q7Z4V0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZNF438Q7Z4V0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZNF438Q7Z4V0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZNF438Q7Z4V0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZNF438Q7Z4V0 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZNF438Q7Z4V0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZNF438Q7Z4V0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNF438Q7Z4V0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNF438Q7Z4V0 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZNF438Q7Z4V0 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZNF438Q7Z4V0 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
ZNF438Q7Z4V0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNF438Q7Z4V0 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF438Q7Z4V0 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF438Q7Z4V0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF438Q7Z4V0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF438Q7Z4V0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF438Q7Z4V0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF438Q7Z4V0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF438Q7Z4V0 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF438Q7Z4V0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF438Q7Z4V0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF438Q7Z4V0 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF438Q7Z4V0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF438Q7Z4V0 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF438Q7Z4V0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF438Q7Z4V0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF438Q7Z4V0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF438Q7Z4V0 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF438Q7Z4V0 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF438Q7Z4V0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF438Q7Z4V0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF438Q7Z4V0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF438Q7Z4V0 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF438Q7Z4V0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF438Q7Z4V0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF438Q7Z4V0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF438Q7Z4V0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF438Q7Z4V0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF438Q7Z4V0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF438Q7Z4V0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF438Q7Z4V0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF438Q7Z4V0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF438Q7Z4V0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF438Q7Z4V0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF438Q7Z4V0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF438Q7Z4V0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF438Q7Z4V0 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF438Q7Z4V0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNF438Q7Z4V0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNF438Q7Z4V0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNF438Q7Z4V0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNF438Q7Z4V0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNF438Q7Z4V0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF438Q7Z4V0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF438Q7Z4V0 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF438Q7Z4V0 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF438Q7Z4V0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF438Q7Z4V0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF438Q7Z4V0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF438Q7Z4V0 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF438Q7Z4V0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF438Q7Z4V0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF438Q7Z4V0 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF438Q7Z4V0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNF438Q7Z4V0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNF438Q7Z4V0 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNF438Q7Z4V0 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZNF438Q7Z4V0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZNF438Q7Z4V0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF438Q7Z4V0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF438Q7Z4V0 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF438Q7Z4V0 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNF438Q7Z4V0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNF438Q7Z4V0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNF438Q7Z4V0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF438Q7Z4V0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF438Q7Z4V0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZNF438Q7Z4V0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZNF438Q7Z4V0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ZNF438Q7Z4V0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF438Q7Z4V0 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF438Q7Z4V0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF438Q7Z4V0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF438Q7Z4V0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF438Q7Z4V0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF438Q7Z4V0 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF438Q7Z4V0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF438Q7Z4V0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF438Q7Z4V0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF438Q7Z4V0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF438Q7Z4V0 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF438Q7Z4V0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF438Q7Z4V0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF438Q7Z4V0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF438Q7Z4V0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF438Q7Z4V0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF438Q7Z4V0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF438Q7Z4V0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF438Q7Z4V0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms