Protein–RNA interactions for Protein: Q7L804

RAB11FIP2, Rab11 family-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP2Q7L804 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
RAB11FIP2Q7L804 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAB11FIP2Q7L804 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAB11FIP2Q7L804 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAB11FIP2Q7L804 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAB11FIP2Q7L804 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAB11FIP2Q7L804 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAB11FIP2Q7L804 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAB11FIP2Q7L804 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RAB11FIP2Q7L804 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RAB11FIP2Q7L804 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RAB11FIP2Q7L804 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
RAB11FIP2Q7L804 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAB11FIP2Q7L804 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAB11FIP2Q7L804 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
RAB11FIP2Q7L804 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAB11FIP2Q7L804 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAB11FIP2Q7L804 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAB11FIP2Q7L804 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAB11FIP2Q7L804 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAB11FIP2Q7L804 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAB11FIP2Q7L804 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAB11FIP2Q7L804 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAB11FIP2Q7L804 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAB11FIP2Q7L804 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAB11FIP2Q7L804 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAB11FIP2Q7L804 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAB11FIP2Q7L804 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAB11FIP2Q7L804 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAB11FIP2Q7L804 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAB11FIP2Q7L804 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAB11FIP2Q7L804 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAB11FIP2Q7L804 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAB11FIP2Q7L804 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAB11FIP2Q7L804 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB11FIP2Q7L804 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB11FIP2Q7L804 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB11FIP2Q7L804 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAB11FIP2Q7L804 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAB11FIP2Q7L804 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAB11FIP2Q7L804 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAB11FIP2Q7L804 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAB11FIP2Q7L804 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
RAB11FIP2Q7L804 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAB11FIP2Q7L804 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAB11FIP2Q7L804 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAB11FIP2Q7L804 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAB11FIP2Q7L804 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAB11FIP2Q7L804 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
RAB11FIP2Q7L804 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAB11FIP2Q7L804 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAB11FIP2Q7L804 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAB11FIP2Q7L804 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAB11FIP2Q7L804 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RAB11FIP2Q7L804 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RAB11FIP2Q7L804 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAB11FIP2Q7L804 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAB11FIP2Q7L804 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAB11FIP2Q7L804 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAB11FIP2Q7L804 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAB11FIP2Q7L804 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAB11FIP2Q7L804 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAB11FIP2Q7L804 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RAB11FIP2Q7L804 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAB11FIP2Q7L804 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAB11FIP2Q7L804 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAB11FIP2Q7L804 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB11FIP2Q7L804 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB11FIP2Q7L804 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAB11FIP2Q7L804 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAB11FIP2Q7L804 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB11FIP2Q7L804 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB11FIP2Q7L804 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB11FIP2Q7L804 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB11FIP2Q7L804 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB11FIP2Q7L804 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB11FIP2Q7L804 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB11FIP2Q7L804 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB11FIP2Q7L804 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAB11FIP2Q7L804 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAB11FIP2Q7L804 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB11FIP2Q7L804 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB11FIP2Q7L804 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB11FIP2Q7L804 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB11FIP2Q7L804 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAB11FIP2Q7L804 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAB11FIP2Q7L804 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAB11FIP2Q7L804 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB11FIP2Q7L804 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB11FIP2Q7L804 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB11FIP2Q7L804 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB11FIP2Q7L804 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB11FIP2Q7L804 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB11FIP2Q7L804 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB11FIP2Q7L804 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RAB11FIP2Q7L804 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB11FIP2Q7L804 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB11FIP2Q7L804 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB11FIP2Q7L804 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB11FIP2Q7L804 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms