Protein–RNA interactions for Protein: Q6W4X9

MUC6, Mucin-6, humanhuman

Predictions only

Length 2,439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MUC6Q6W4X9 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
MUC6Q6W4X9 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
MUC6Q6W4X9 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
MUC6Q6W4X9 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MUC6Q6W4X9 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MUC6Q6W4X9 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MUC6Q6W4X9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MUC6Q6W4X9 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MUC6Q6W4X9 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
MUC6Q6W4X9 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
MUC6Q6W4X9 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
MUC6Q6W4X9 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
MUC6Q6W4X9 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MUC6Q6W4X9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MUC6Q6W4X9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MUC6Q6W4X9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MUC6Q6W4X9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MUC6Q6W4X9 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MUC6Q6W4X9 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MUC6Q6W4X9 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MUC6Q6W4X9 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MUC6Q6W4X9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MUC6Q6W4X9 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MUC6Q6W4X9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
MUC6Q6W4X9 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MUC6Q6W4X9 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MUC6Q6W4X9 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
MUC6Q6W4X9 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
MUC6Q6W4X9 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
MUC6Q6W4X9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MUC6Q6W4X9 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MUC6Q6W4X9 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MUC6Q6W4X9 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MUC6Q6W4X9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MUC6Q6W4X9 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MUC6Q6W4X9 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MUC6Q6W4X9 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MUC6Q6W4X9 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MUC6Q6W4X9 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MUC6Q6W4X9 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MUC6Q6W4X9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MUC6Q6W4X9 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MUC6Q6W4X9 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
MUC6Q6W4X9 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MUC6Q6W4X9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
MUC6Q6W4X9 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MUC6Q6W4X9 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MUC6Q6W4X9 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MUC6Q6W4X9 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MUC6Q6W4X9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MUC6Q6W4X9 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
MUC6Q6W4X9 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MUC6Q6W4X9 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
MUC6Q6W4X9 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MUC6Q6W4X9 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MUC6Q6W4X9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MUC6Q6W4X9 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MUC6Q6W4X9 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
MUC6Q6W4X9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MUC6Q6W4X9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MUC6Q6W4X9 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MUC6Q6W4X9 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MUC6Q6W4X9 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MUC6Q6W4X9 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MUC6Q6W4X9 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MUC6Q6W4X9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MUC6Q6W4X9 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MUC6Q6W4X9 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
MUC6Q6W4X9 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MUC6Q6W4X9 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MUC6Q6W4X9 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MUC6Q6W4X9 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MUC6Q6W4X9 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.08■■□□□ 1.76
MUC6Q6W4X9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MUC6Q6W4X9 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MUC6Q6W4X9 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MUC6Q6W4X9 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MUC6Q6W4X9 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MUC6Q6W4X9 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MUC6Q6W4X9 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MUC6Q6W4X9 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MUC6Q6W4X9 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MUC6Q6W4X9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MUC6Q6W4X9 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MUC6Q6W4X9 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MUC6Q6W4X9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MUC6Q6W4X9 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MUC6Q6W4X9 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MUC6Q6W4X9 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MUC6Q6W4X9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MUC6Q6W4X9 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MUC6Q6W4X9 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
MUC6Q6W4X9 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
MUC6Q6W4X9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
MUC6Q6W4X9 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MUC6Q6W4X9 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MUC6Q6W4X9 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
MUC6Q6W4X9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MUC6Q6W4X9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MUC6Q6W4X9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms