Protein–RNA interactions for Protein: Q6VY07

PACS1, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1Q6VY07 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PACS1Q6VY07 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PACS1Q6VY07 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PACS1Q6VY07 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PACS1Q6VY07 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PACS1Q6VY07 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PACS1Q6VY07 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PACS1Q6VY07 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PACS1Q6VY07 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PACS1Q6VY07 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
PACS1Q6VY07 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PACS1Q6VY07 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PACS1Q6VY07 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PACS1Q6VY07 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PACS1Q6VY07 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PACS1Q6VY07 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PACS1Q6VY07 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PACS1Q6VY07 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PACS1Q6VY07 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PACS1Q6VY07 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PACS1Q6VY07 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PACS1Q6VY07 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PACS1Q6VY07 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PACS1Q6VY07 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PACS1Q6VY07 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PACS1Q6VY07 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PACS1Q6VY07 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PACS1Q6VY07 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PACS1Q6VY07 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PACS1Q6VY07 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PACS1Q6VY07 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PACS1Q6VY07 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PACS1Q6VY07 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PACS1Q6VY07 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PACS1Q6VY07 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PACS1Q6VY07 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PACS1Q6VY07 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PACS1Q6VY07 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PACS1Q6VY07 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PACS1Q6VY07 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PACS1Q6VY07 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PACS1Q6VY07 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PACS1Q6VY07 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PACS1Q6VY07 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PACS1Q6VY07 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PACS1Q6VY07 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PACS1Q6VY07 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PACS1Q6VY07 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PACS1Q6VY07 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PACS1Q6VY07 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PACS1Q6VY07 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PACS1Q6VY07 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PACS1Q6VY07 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PACS1Q6VY07 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PACS1Q6VY07 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PACS1Q6VY07 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PACS1Q6VY07 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PACS1Q6VY07 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PACS1Q6VY07 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PACS1Q6VY07 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PACS1Q6VY07 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PACS1Q6VY07 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PACS1Q6VY07 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PACS1Q6VY07 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PACS1Q6VY07 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PACS1Q6VY07 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PACS1Q6VY07 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PACS1Q6VY07 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PACS1Q6VY07 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PACS1Q6VY07 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PACS1Q6VY07 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PACS1Q6VY07 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PACS1Q6VY07 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PACS1Q6VY07 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PACS1Q6VY07 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PACS1Q6VY07 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PACS1Q6VY07 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PACS1Q6VY07 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PACS1Q6VY07 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PACS1Q6VY07 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PACS1Q6VY07 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PACS1Q6VY07 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PACS1Q6VY07 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PACS1Q6VY07 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PACS1Q6VY07 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
PACS1Q6VY07 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PACS1Q6VY07 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PACS1Q6VY07 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PACS1Q6VY07 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PACS1Q6VY07 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PACS1Q6VY07 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PACS1Q6VY07 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PACS1Q6VY07 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PACS1Q6VY07 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PACS1Q6VY07 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PACS1Q6VY07 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PACS1Q6VY07 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PACS1Q6VY07 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PACS1Q6VY07 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PACS1Q6VY07 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms