Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXK5

LRRN1, Leucine-rich repeat neuronal protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN1Q6UXK5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRN1Q6UXK5 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRN1Q6UXK5 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRN1Q6UXK5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRN1Q6UXK5 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRN1Q6UXK5 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRN1Q6UXK5 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRN1Q6UXK5 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRN1Q6UXK5 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRN1Q6UXK5 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRN1Q6UXK5 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRN1Q6UXK5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRN1Q6UXK5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRN1Q6UXK5 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRN1Q6UXK5 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRN1Q6UXK5 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LRRN1Q6UXK5 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRN1Q6UXK5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRN1Q6UXK5 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRN1Q6UXK5 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRN1Q6UXK5 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRN1Q6UXK5 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRN1Q6UXK5 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRN1Q6UXK5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRN1Q6UXK5 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRN1Q6UXK5 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRN1Q6UXK5 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRN1Q6UXK5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRN1Q6UXK5 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRN1Q6UXK5 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRN1Q6UXK5 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRN1Q6UXK5 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRN1Q6UXK5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRN1Q6UXK5 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRN1Q6UXK5 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRN1Q6UXK5 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRN1Q6UXK5 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRN1Q6UXK5 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRN1Q6UXK5 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRN1Q6UXK5 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRN1Q6UXK5 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRN1Q6UXK5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRN1Q6UXK5 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRN1Q6UXK5 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRN1Q6UXK5 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRN1Q6UXK5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRN1Q6UXK5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRN1Q6UXK5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRN1Q6UXK5 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRN1Q6UXK5 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRN1Q6UXK5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRN1Q6UXK5 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRN1Q6UXK5 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRN1Q6UXK5 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRN1Q6UXK5 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRN1Q6UXK5 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRN1Q6UXK5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRN1Q6UXK5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRN1Q6UXK5 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRN1Q6UXK5 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRN1Q6UXK5 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRN1Q6UXK5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRN1Q6UXK5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRN1Q6UXK5 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRN1Q6UXK5 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRN1Q6UXK5 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRN1Q6UXK5 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRN1Q6UXK5 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRN1Q6UXK5 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRRN1Q6UXK5 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRRN1Q6UXK5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRRN1Q6UXK5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
LRRN1Q6UXK5 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRN1Q6UXK5 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRN1Q6UXK5 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRN1Q6UXK5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRN1Q6UXK5 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRN1Q6UXK5 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRN1Q6UXK5 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRN1Q6UXK5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRN1Q6UXK5 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRN1Q6UXK5 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRN1Q6UXK5 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRN1Q6UXK5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRN1Q6UXK5 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRN1Q6UXK5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRN1Q6UXK5 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRN1Q6UXK5 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRN1Q6UXK5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRN1Q6UXK5 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRN1Q6UXK5 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRN1Q6UXK5 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRN1Q6UXK5 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRN1Q6UXK5 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRN1Q6UXK5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRN1Q6UXK5 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRN1Q6UXK5 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRN1Q6UXK5 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRN1Q6UXK5 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRN1Q6UXK5 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms