Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXB2

CXCL17, C-X-C motif chemokine 17, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL17Q6UXB2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CXCL17Q6UXB2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CXCL17Q6UXB2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CXCL17Q6UXB2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CXCL17Q6UXB2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CXCL17Q6UXB2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CXCL17Q6UXB2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CXCL17Q6UXB2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CXCL17Q6UXB2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CXCL17Q6UXB2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CXCL17Q6UXB2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CXCL17Q6UXB2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CXCL17Q6UXB2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CXCL17Q6UXB2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CXCL17Q6UXB2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CXCL17Q6UXB2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CXCL17Q6UXB2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CXCL17Q6UXB2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CXCL17Q6UXB2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
CXCL17Q6UXB2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CXCL17Q6UXB2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CXCL17Q6UXB2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CXCL17Q6UXB2 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CXCL17Q6UXB2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CXCL17Q6UXB2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CXCL17Q6UXB2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CXCL17Q6UXB2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CXCL17Q6UXB2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CXCL17Q6UXB2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CXCL17Q6UXB2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CXCL17Q6UXB2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CXCL17Q6UXB2 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CXCL17Q6UXB2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CXCL17Q6UXB2 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CXCL17Q6UXB2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CXCL17Q6UXB2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CXCL17Q6UXB2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
CXCL17Q6UXB2 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CXCL17Q6UXB2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CXCL17Q6UXB2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
CXCL17Q6UXB2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CXCL17Q6UXB2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CXCL17Q6UXB2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CXCL17Q6UXB2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CXCL17Q6UXB2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CXCL17Q6UXB2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CXCL17Q6UXB2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
CXCL17Q6UXB2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CXCL17Q6UXB2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CXCL17Q6UXB2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CXCL17Q6UXB2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
CXCL17Q6UXB2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CXCL17Q6UXB2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CXCL17Q6UXB2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CXCL17Q6UXB2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CXCL17Q6UXB2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CXCL17Q6UXB2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
CXCL17Q6UXB2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
CXCL17Q6UXB2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CXCL17Q6UXB2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CXCL17Q6UXB2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CXCL17Q6UXB2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CXCL17Q6UXB2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CXCL17Q6UXB2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CXCL17Q6UXB2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CXCL17Q6UXB2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CXCL17Q6UXB2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CXCL17Q6UXB2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
CXCL17Q6UXB2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CXCL17Q6UXB2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
CXCL17Q6UXB2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CXCL17Q6UXB2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CXCL17Q6UXB2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CXCL17Q6UXB2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CXCL17Q6UXB2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CXCL17Q6UXB2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CXCL17Q6UXB2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CXCL17Q6UXB2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
CXCL17Q6UXB2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CXCL17Q6UXB2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CXCL17Q6UXB2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
CXCL17Q6UXB2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CXCL17Q6UXB2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CXCL17Q6UXB2 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CXCL17Q6UXB2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CXCL17Q6UXB2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CXCL17Q6UXB2 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CXCL17Q6UXB2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CXCL17Q6UXB2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CXCL17Q6UXB2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
CXCL17Q6UXB2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CXCL17Q6UXB2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CXCL17Q6UXB2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CXCL17Q6UXB2 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CXCL17Q6UXB2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CXCL17Q6UXB2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CXCL17Q6UXB2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CXCL17Q6UXB2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CXCL17Q6UXB2 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CXCL17Q6UXB2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.7 ms