Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWF9

FAM180A, Protein FAM180A, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM180AQ6UWF9 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FAM180AQ6UWF9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FAM180AQ6UWF9 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FAM180AQ6UWF9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FAM180AQ6UWF9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FAM180AQ6UWF9 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
FAM180AQ6UWF9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FAM180AQ6UWF9 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FAM180AQ6UWF9 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FAM180AQ6UWF9 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FAM180AQ6UWF9 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FAM180AQ6UWF9 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FAM180AQ6UWF9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FAM180AQ6UWF9 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FAM180AQ6UWF9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FAM180AQ6UWF9 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FAM180AQ6UWF9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
FAM180AQ6UWF9 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FAM180AQ6UWF9 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FAM180AQ6UWF9 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FAM180AQ6UWF9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FAM180AQ6UWF9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM180AQ6UWF9 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM180AQ6UWF9 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM180AQ6UWF9 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM180AQ6UWF9 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM180AQ6UWF9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM180AQ6UWF9 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM180AQ6UWF9 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM180AQ6UWF9 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM180AQ6UWF9 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM180AQ6UWF9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM180AQ6UWF9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM180AQ6UWF9 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM180AQ6UWF9 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM180AQ6UWF9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM180AQ6UWF9 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM180AQ6UWF9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM180AQ6UWF9 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM180AQ6UWF9 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM180AQ6UWF9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM180AQ6UWF9 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM180AQ6UWF9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM180AQ6UWF9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM180AQ6UWF9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM180AQ6UWF9 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM180AQ6UWF9 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM180AQ6UWF9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM180AQ6UWF9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FAM180AQ6UWF9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FAM180AQ6UWF9 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FAM180AQ6UWF9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM180AQ6UWF9 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM180AQ6UWF9 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM180AQ6UWF9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM180AQ6UWF9 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM180AQ6UWF9 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM180AQ6UWF9 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM180AQ6UWF9 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM180AQ6UWF9 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM180AQ6UWF9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM180AQ6UWF9 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM180AQ6UWF9 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM180AQ6UWF9 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM180AQ6UWF9 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FAM180AQ6UWF9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FAM180AQ6UWF9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FAM180AQ6UWF9 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM180AQ6UWF9 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM180AQ6UWF9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM180AQ6UWF9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM180AQ6UWF9 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM180AQ6UWF9 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM180AQ6UWF9 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM180AQ6UWF9 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM180AQ6UWF9 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM180AQ6UWF9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM180AQ6UWF9 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM180AQ6UWF9 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM180AQ6UWF9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
FAM180AQ6UWF9 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM180AQ6UWF9 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM180AQ6UWF9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM180AQ6UWF9 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM180AQ6UWF9 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM180AQ6UWF9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM180AQ6UWF9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM180AQ6UWF9 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM180AQ6UWF9 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM180AQ6UWF9 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM180AQ6UWF9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM180AQ6UWF9 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM180AQ6UWF9 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM180AQ6UWF9 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM180AQ6UWF9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM180AQ6UWF9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM180AQ6UWF9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM180AQ6UWF9 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM180AQ6UWF9 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM180AQ6UWF9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms