Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5L8

SHC4, SHC-transforming protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHC4Q6S5L8 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
SHC4Q6S5L8 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SHC4Q6S5L8 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SHC4Q6S5L8 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SHC4Q6S5L8 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SHC4Q6S5L8 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SHC4Q6S5L8 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SHC4Q6S5L8 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SHC4Q6S5L8 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SHC4Q6S5L8 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SHC4Q6S5L8 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SHC4Q6S5L8 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SHC4Q6S5L8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SHC4Q6S5L8 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SHC4Q6S5L8 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SHC4Q6S5L8 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SHC4Q6S5L8 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SHC4Q6S5L8 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SHC4Q6S5L8 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SHC4Q6S5L8 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SHC4Q6S5L8 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
SHC4Q6S5L8 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SHC4Q6S5L8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SHC4Q6S5L8 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SHC4Q6S5L8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SHC4Q6S5L8 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SHC4Q6S5L8 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SHC4Q6S5L8 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SHC4Q6S5L8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SHC4Q6S5L8 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SHC4Q6S5L8 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SHC4Q6S5L8 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SHC4Q6S5L8 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
SHC4Q6S5L8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SHC4Q6S5L8 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SHC4Q6S5L8 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SHC4Q6S5L8 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
SHC4Q6S5L8 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
SHC4Q6S5L8 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SHC4Q6S5L8 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SHC4Q6S5L8 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SHC4Q6S5L8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SHC4Q6S5L8 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SHC4Q6S5L8 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
SHC4Q6S5L8 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SHC4Q6S5L8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
SHC4Q6S5L8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SHC4Q6S5L8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SHC4Q6S5L8 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SHC4Q6S5L8 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SHC4Q6S5L8 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SHC4Q6S5L8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SHC4Q6S5L8 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SHC4Q6S5L8 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SHC4Q6S5L8 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SHC4Q6S5L8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SHC4Q6S5L8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SHC4Q6S5L8 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SHC4Q6S5L8 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SHC4Q6S5L8 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
SHC4Q6S5L8 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SHC4Q6S5L8 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SHC4Q6S5L8 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SHC4Q6S5L8 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SHC4Q6S5L8 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SHC4Q6S5L8 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SHC4Q6S5L8 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SHC4Q6S5L8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SHC4Q6S5L8 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SHC4Q6S5L8 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
SHC4Q6S5L8 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SHC4Q6S5L8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SHC4Q6S5L8 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
SHC4Q6S5L8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SHC4Q6S5L8 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SHC4Q6S5L8 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SHC4Q6S5L8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SHC4Q6S5L8 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
SHC4Q6S5L8 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
SHC4Q6S5L8 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
SHC4Q6S5L8 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SHC4Q6S5L8 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SHC4Q6S5L8 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SHC4Q6S5L8 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
SHC4Q6S5L8 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SHC4Q6S5L8 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SHC4Q6S5L8 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SHC4Q6S5L8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SHC4Q6S5L8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SHC4Q6S5L8 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SHC4Q6S5L8 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
SHC4Q6S5L8 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
SHC4Q6S5L8 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SHC4Q6S5L8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SHC4Q6S5L8 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SHC4Q6S5L8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SHC4Q6S5L8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SHC4Q6S5L8 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SHC4Q6S5L8 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
SHC4Q6S5L8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.7 ms