Protein–RNA interactions for Protein: Q6RUI8

C19orf48, Uncharacterized protein C19orf48, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C19orf48Q6RUI8 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
C19orf48Q6RUI8 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
C19orf48Q6RUI8 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
C19orf48Q6RUI8 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
C19orf48Q6RUI8 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
C19orf48Q6RUI8 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
C19orf48Q6RUI8 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
C19orf48Q6RUI8 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
C19orf48Q6RUI8 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
C19orf48Q6RUI8 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
C19orf48Q6RUI8 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
C19orf48Q6RUI8 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
C19orf48Q6RUI8 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
C19orf48Q6RUI8 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
C19orf48Q6RUI8 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
C19orf48Q6RUI8 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
C19orf48Q6RUI8 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
C19orf48Q6RUI8 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
C19orf48Q6RUI8 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
C19orf48Q6RUI8 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
C19orf48Q6RUI8 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
C19orf48Q6RUI8 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
C19orf48Q6RUI8 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
C19orf48Q6RUI8 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
C19orf48Q6RUI8 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
C19orf48Q6RUI8 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
C19orf48Q6RUI8 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
C19orf48Q6RUI8 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
C19orf48Q6RUI8 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
C19orf48Q6RUI8 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
C19orf48Q6RUI8 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
C19orf48Q6RUI8 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
C19orf48Q6RUI8 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
C19orf48Q6RUI8 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
C19orf48Q6RUI8 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
C19orf48Q6RUI8 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
C19orf48Q6RUI8 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
C19orf48Q6RUI8 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
C19orf48Q6RUI8 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
C19orf48Q6RUI8 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
C19orf48Q6RUI8 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
C19orf48Q6RUI8 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
C19orf48Q6RUI8 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
C19orf48Q6RUI8 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
C19orf48Q6RUI8 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
C19orf48Q6RUI8 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
C19orf48Q6RUI8 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
C19orf48Q6RUI8 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
C19orf48Q6RUI8 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
C19orf48Q6RUI8 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
C19orf48Q6RUI8 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
C19orf48Q6RUI8 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
C19orf48Q6RUI8 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
C19orf48Q6RUI8 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
C19orf48Q6RUI8 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
C19orf48Q6RUI8 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
C19orf48Q6RUI8 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C19orf48Q6RUI8 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C19orf48Q6RUI8 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
C19orf48Q6RUI8 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
C19orf48Q6RUI8 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
C19orf48Q6RUI8 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
C19orf48Q6RUI8 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
C19orf48Q6RUI8 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
C19orf48Q6RUI8 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
C19orf48Q6RUI8 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
C19orf48Q6RUI8 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
C19orf48Q6RUI8 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
C19orf48Q6RUI8 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
C19orf48Q6RUI8 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
C19orf48Q6RUI8 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
C19orf48Q6RUI8 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
C19orf48Q6RUI8 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
C19orf48Q6RUI8 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
C19orf48Q6RUI8 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
C19orf48Q6RUI8 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
C19orf48Q6RUI8 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
C19orf48Q6RUI8 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
C19orf48Q6RUI8 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
C19orf48Q6RUI8 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
C19orf48Q6RUI8 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
C19orf48Q6RUI8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
C19orf48Q6RUI8 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
C19orf48Q6RUI8 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
C19orf48Q6RUI8 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
C19orf48Q6RUI8 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
C19orf48Q6RUI8 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
C19orf48Q6RUI8 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
C19orf48Q6RUI8 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
C19orf48Q6RUI8 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
C19orf48Q6RUI8 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
C19orf48Q6RUI8 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
C19orf48Q6RUI8 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
C19orf48Q6RUI8 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
C19orf48Q6RUI8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
C19orf48Q6RUI8 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
C19orf48Q6RUI8 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
C19orf48Q6RUI8 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
C19orf48Q6RUI8 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
C19orf48Q6RUI8 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1031.4 ms