Protein–RNA interactions for Protein: Q6P087

RPUSD3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase RPUSD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD3Q6P087 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPUSD3Q6P087 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPUSD3Q6P087 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPUSD3Q6P087 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPUSD3Q6P087 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPUSD3Q6P087 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RPUSD3Q6P087 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPUSD3Q6P087 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPUSD3Q6P087 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPUSD3Q6P087 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPUSD3Q6P087 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPUSD3Q6P087 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPUSD3Q6P087 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPUSD3Q6P087 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPUSD3Q6P087 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
RPUSD3Q6P087 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPUSD3Q6P087 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPUSD3Q6P087 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPUSD3Q6P087 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPUSD3Q6P087 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPUSD3Q6P087 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPUSD3Q6P087 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPUSD3Q6P087 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPUSD3Q6P087 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPUSD3Q6P087 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPUSD3Q6P087 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPUSD3Q6P087 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RPUSD3Q6P087 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RPUSD3Q6P087 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPUSD3Q6P087 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPUSD3Q6P087 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPUSD3Q6P087 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPUSD3Q6P087 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPUSD3Q6P087 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPUSD3Q6P087 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPUSD3Q6P087 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPUSD3Q6P087 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPUSD3Q6P087 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPUSD3Q6P087 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPUSD3Q6P087 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPUSD3Q6P087 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPUSD3Q6P087 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPUSD3Q6P087 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RPUSD3Q6P087 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPUSD3Q6P087 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPUSD3Q6P087 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPUSD3Q6P087 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPUSD3Q6P087 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RPUSD3Q6P087 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPUSD3Q6P087 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPUSD3Q6P087 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPUSD3Q6P087 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPUSD3Q6P087 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPUSD3Q6P087 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPUSD3Q6P087 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPUSD3Q6P087 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPUSD3Q6P087 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPUSD3Q6P087 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPUSD3Q6P087 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPUSD3Q6P087 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPUSD3Q6P087 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPUSD3Q6P087 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RPUSD3Q6P087 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RPUSD3Q6P087 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RPUSD3Q6P087 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RPUSD3Q6P087 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RPUSD3Q6P087 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
RPUSD3Q6P087 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPUSD3Q6P087 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPUSD3Q6P087 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPUSD3Q6P087 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPUSD3Q6P087 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPUSD3Q6P087 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPUSD3Q6P087 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RPUSD3Q6P087 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPUSD3Q6P087 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPUSD3Q6P087 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPUSD3Q6P087 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPUSD3Q6P087 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPUSD3Q6P087 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPUSD3Q6P087 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RPUSD3Q6P087 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPUSD3Q6P087 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPUSD3Q6P087 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPUSD3Q6P087 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
RPUSD3Q6P087 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPUSD3Q6P087 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPUSD3Q6P087 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RPUSD3Q6P087 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPUSD3Q6P087 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPUSD3Q6P087 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPUSD3Q6P087 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPUSD3Q6P087 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPUSD3Q6P087 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPUSD3Q6P087 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPUSD3Q6P087 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPUSD3Q6P087 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPUSD3Q6P087 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPUSD3Q6P087 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RPUSD3Q6P087 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms