Protein–RNA interactions for Protein: Q6DKK2

TTC19, Tetratricopeptide repeat protein 19, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC19Q6DKK2 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TTC19Q6DKK2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TTC19Q6DKK2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TTC19Q6DKK2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TTC19Q6DKK2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TTC19Q6DKK2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TTC19Q6DKK2 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TTC19Q6DKK2 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TTC19Q6DKK2 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TTC19Q6DKK2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TTC19Q6DKK2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TTC19Q6DKK2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TTC19Q6DKK2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TTC19Q6DKK2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TTC19Q6DKK2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TTC19Q6DKK2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TTC19Q6DKK2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TTC19Q6DKK2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TTC19Q6DKK2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TTC19Q6DKK2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TTC19Q6DKK2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TTC19Q6DKK2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TTC19Q6DKK2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TTC19Q6DKK2 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TTC19Q6DKK2 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TTC19Q6DKK2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TTC19Q6DKK2 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TTC19Q6DKK2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TTC19Q6DKK2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TTC19Q6DKK2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TTC19Q6DKK2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TTC19Q6DKK2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TTC19Q6DKK2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TTC19Q6DKK2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TTC19Q6DKK2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TTC19Q6DKK2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TTC19Q6DKK2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TTC19Q6DKK2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TTC19Q6DKK2 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TTC19Q6DKK2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TTC19Q6DKK2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TTC19Q6DKK2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TTC19Q6DKK2 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TTC19Q6DKK2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TTC19Q6DKK2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TTC19Q6DKK2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TTC19Q6DKK2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TTC19Q6DKK2 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TTC19Q6DKK2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TTC19Q6DKK2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TTC19Q6DKK2 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TTC19Q6DKK2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TTC19Q6DKK2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TTC19Q6DKK2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TTC19Q6DKK2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TTC19Q6DKK2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TTC19Q6DKK2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TTC19Q6DKK2 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TTC19Q6DKK2 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TTC19Q6DKK2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TTC19Q6DKK2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TTC19Q6DKK2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TTC19Q6DKK2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TTC19Q6DKK2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TTC19Q6DKK2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TTC19Q6DKK2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TTC19Q6DKK2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TTC19Q6DKK2 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TTC19Q6DKK2 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TTC19Q6DKK2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TTC19Q6DKK2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TTC19Q6DKK2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TTC19Q6DKK2 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TTC19Q6DKK2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TTC19Q6DKK2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TTC19Q6DKK2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TTC19Q6DKK2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TTC19Q6DKK2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TTC19Q6DKK2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TTC19Q6DKK2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TTC19Q6DKK2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TTC19Q6DKK2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TTC19Q6DKK2 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TTC19Q6DKK2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TTC19Q6DKK2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TTC19Q6DKK2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TTC19Q6DKK2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
TTC19Q6DKK2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
TTC19Q6DKK2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TTC19Q6DKK2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TTC19Q6DKK2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TTC19Q6DKK2 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
TTC19Q6DKK2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
TTC19Q6DKK2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TTC19Q6DKK2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TTC19Q6DKK2 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TTC19Q6DKK2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TTC19Q6DKK2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TTC19Q6DKK2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TTC19Q6DKK2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms