Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWW1

C1QL3, Complement C1q-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QL3Q5VWW1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
C1QL3Q5VWW1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
C1QL3Q5VWW1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
C1QL3Q5VWW1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
C1QL3Q5VWW1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
C1QL3Q5VWW1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
C1QL3Q5VWW1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
C1QL3Q5VWW1 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
C1QL3Q5VWW1 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
C1QL3Q5VWW1 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
C1QL3Q5VWW1 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
C1QL3Q5VWW1 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
C1QL3Q5VWW1 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
C1QL3Q5VWW1 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
C1QL3Q5VWW1 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
C1QL3Q5VWW1 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
C1QL3Q5VWW1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
C1QL3Q5VWW1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C1QL3Q5VWW1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
C1QL3Q5VWW1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C1QL3Q5VWW1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C1QL3Q5VWW1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
C1QL3Q5VWW1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C1QL3Q5VWW1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C1QL3Q5VWW1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
C1QL3Q5VWW1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
C1QL3Q5VWW1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
C1QL3Q5VWW1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
C1QL3Q5VWW1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
C1QL3Q5VWW1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C1QL3Q5VWW1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
C1QL3Q5VWW1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
C1QL3Q5VWW1 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
C1QL3Q5VWW1 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C1QL3Q5VWW1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
C1QL3Q5VWW1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
C1QL3Q5VWW1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C1QL3Q5VWW1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C1QL3Q5VWW1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
C1QL3Q5VWW1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C1QL3Q5VWW1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C1QL3Q5VWW1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C1QL3Q5VWW1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C1QL3Q5VWW1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
C1QL3Q5VWW1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
C1QL3Q5VWW1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C1QL3Q5VWW1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C1QL3Q5VWW1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C1QL3Q5VWW1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C1QL3Q5VWW1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C1QL3Q5VWW1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C1QL3Q5VWW1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C1QL3Q5VWW1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C1QL3Q5VWW1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C1QL3Q5VWW1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C1QL3Q5VWW1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
C1QL3Q5VWW1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
C1QL3Q5VWW1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C1QL3Q5VWW1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C1QL3Q5VWW1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C1QL3Q5VWW1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C1QL3Q5VWW1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C1QL3Q5VWW1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
C1QL3Q5VWW1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
C1QL3Q5VWW1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C1QL3Q5VWW1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C1QL3Q5VWW1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
C1QL3Q5VWW1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C1QL3Q5VWW1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C1QL3Q5VWW1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
C1QL3Q5VWW1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
C1QL3Q5VWW1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C1QL3Q5VWW1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
C1QL3Q5VWW1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
C1QL3Q5VWW1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C1QL3Q5VWW1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C1QL3Q5VWW1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C1QL3Q5VWW1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
C1QL3Q5VWW1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C1QL3Q5VWW1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C1QL3Q5VWW1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C1QL3Q5VWW1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C1QL3Q5VWW1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C1QL3Q5VWW1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C1QL3Q5VWW1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C1QL3Q5VWW1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
C1QL3Q5VWW1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
C1QL3Q5VWW1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C1QL3Q5VWW1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C1QL3Q5VWW1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
C1QL3Q5VWW1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C1QL3Q5VWW1 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
C1QL3Q5VWW1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C1QL3Q5VWW1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
C1QL3Q5VWW1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C1QL3Q5VWW1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C1QL3Q5VWW1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C1QL3Q5VWW1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C1QL3Q5VWW1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C1QL3Q5VWW1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1001.5 ms