Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW36

FOCAD, Focadhesin, humanhuman

Predictions only

Length 1,801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOCADQ5VW36 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.5
FOCADQ5VW36 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.5
FOCADQ5VW36 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
FOCADQ5VW36 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC30.68■■■□□ 2.5
FOCADQ5VW36 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
FOCADQ5VW36 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
FOCADQ5VW36 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
FOCADQ5VW36 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
FOCADQ5VW36 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
FOCADQ5VW36 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
FOCADQ5VW36 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
FOCADQ5VW36 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC30.66■■■□□ 2.5
FOCADQ5VW36 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
FOCADQ5VW36 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
FOCADQ5VW36 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
FOCADQ5VW36 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
FOCADQ5VW36 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
FOCADQ5VW36 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
FOCADQ5VW36 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
FOCADQ5VW36 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
FOCADQ5VW36 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
FOCADQ5VW36 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
FOCADQ5VW36 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
FOCADQ5VW36 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
FOCADQ5VW36 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
FOCADQ5VW36 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
FOCADQ5VW36 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
FOCADQ5VW36 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
FOCADQ5VW36 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
FOCADQ5VW36 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
FOCADQ5VW36 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
FOCADQ5VW36 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
FOCADQ5VW36 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
FOCADQ5VW36 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
FOCADQ5VW36 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
FOCADQ5VW36 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC30.61■■■□□ 2.49
FOCADQ5VW36 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
FOCADQ5VW36 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
FOCADQ5VW36 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
FOCADQ5VW36 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
FOCADQ5VW36 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
FOCADQ5VW36 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
FOCADQ5VW36 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
FOCADQ5VW36 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
FOCADQ5VW36 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
FOCADQ5VW36 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
FOCADQ5VW36 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.49
FOCADQ5VW36 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
FOCADQ5VW36 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
FOCADQ5VW36 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
FOCADQ5VW36 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
FOCADQ5VW36 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
FOCADQ5VW36 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
FOCADQ5VW36 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
FOCADQ5VW36 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
FOCADQ5VW36 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
FOCADQ5VW36 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
FOCADQ5VW36 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
FOCADQ5VW36 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
FOCADQ5VW36 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
FOCADQ5VW36 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
FOCADQ5VW36 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
FOCADQ5VW36 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
FOCADQ5VW36 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
FOCADQ5VW36 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
FOCADQ5VW36 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
FOCADQ5VW36 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
FOCADQ5VW36 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
FOCADQ5VW36 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
FOCADQ5VW36 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
FOCADQ5VW36 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
FOCADQ5VW36 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
FOCADQ5VW36 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
FOCADQ5VW36 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
FOCADQ5VW36 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
FOCADQ5VW36 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
FOCADQ5VW36 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
FOCADQ5VW36 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
FOCADQ5VW36 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
FOCADQ5VW36 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
FOCADQ5VW36 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
FOCADQ5VW36 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
FOCADQ5VW36 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
FOCADQ5VW36 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
FOCADQ5VW36 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
FOCADQ5VW36 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
FOCADQ5VW36 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
FOCADQ5VW36 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
FOCADQ5VW36 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
FOCADQ5VW36 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
FOCADQ5VW36 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
FOCADQ5VW36 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
FOCADQ5VW36 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
FOCADQ5VW36 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC30.45■■■□□ 2.47
FOCADQ5VW36 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
FOCADQ5VW36 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.46
FOCADQ5VW36 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.46
FOCADQ5VW36 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
FOCADQ5VW36 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
FOCADQ5VW36 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms