Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUJ9

EFCAB2, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB2Q5VUJ9 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC39.77■■■■□ 3.96
EFCAB2Q5VUJ9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC39.77■■■■□ 3.96
EFCAB2Q5VUJ9 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
EFCAB2Q5VUJ9 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.76■■■■□ 3.96
EFCAB2Q5VUJ9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.96
EFCAB2Q5VUJ9 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
EFCAB2Q5VUJ9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
EFCAB2Q5VUJ9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC39.75■■■■□ 3.95
EFCAB2Q5VUJ9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
EFCAB2Q5VUJ9 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC39.73■■■■□ 3.95
EFCAB2Q5VUJ9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.73■■■■□ 3.95
EFCAB2Q5VUJ9 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.73■■■■□ 3.95
EFCAB2Q5VUJ9 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
EFCAB2Q5VUJ9 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC39.73■■■■□ 3.95
EFCAB2Q5VUJ9 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC39.73■■■■□ 3.95
EFCAB2Q5VUJ9 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC39.73■■■■□ 3.95
EFCAB2Q5VUJ9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
EFCAB2Q5VUJ9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC39.72■■■■□ 3.95
EFCAB2Q5VUJ9 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC39.72■■■■□ 3.95
EFCAB2Q5VUJ9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC39.71■■■■□ 3.95
EFCAB2Q5VUJ9 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
EFCAB2Q5VUJ9 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
EFCAB2Q5VUJ9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC39.7■■■■□ 3.95
EFCAB2Q5VUJ9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC39.7■■■■□ 3.95
EFCAB2Q5VUJ9 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC39.7■■■■□ 3.95
EFCAB2Q5VUJ9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.69■■■■□ 3.94
EFCAB2Q5VUJ9 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC39.68■■■■□ 3.94
EFCAB2Q5VUJ9 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
EFCAB2Q5VUJ9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC39.68■■■■□ 3.94
EFCAB2Q5VUJ9 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC39.68■■■■□ 3.94
EFCAB2Q5VUJ9 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC39.67■■■■□ 3.94
EFCAB2Q5VUJ9 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC39.67■■■■□ 3.94
EFCAB2Q5VUJ9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
EFCAB2Q5VUJ9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
EFCAB2Q5VUJ9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.66■■■■□ 3.94
EFCAB2Q5VUJ9 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC39.65■■■■□ 3.94
EFCAB2Q5VUJ9 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
EFCAB2Q5VUJ9 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC39.64■■■■□ 3.94
EFCAB2Q5VUJ9 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.61■■■■□ 3.93
EFCAB2Q5VUJ9 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.61■■■■□ 3.93
EFCAB2Q5VUJ9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
EFCAB2Q5VUJ9 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC39.6■■■■□ 3.93
EFCAB2Q5VUJ9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
EFCAB2Q5VUJ9 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC39.59■■■■□ 3.93
EFCAB2Q5VUJ9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.59■■■■□ 3.93
EFCAB2Q5VUJ9 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
EFCAB2Q5VUJ9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC39.58■■■■□ 3.93
EFCAB2Q5VUJ9 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.93
EFCAB2Q5VUJ9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC39.56■■■■□ 3.92
EFCAB2Q5VUJ9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
EFCAB2Q5VUJ9 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC39.55■■■■□ 3.92
EFCAB2Q5VUJ9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.55■■■■□ 3.92
EFCAB2Q5VUJ9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
EFCAB2Q5VUJ9 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
EFCAB2Q5VUJ9 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC39.54■■■■□ 3.92
EFCAB2Q5VUJ9 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC39.54■■■■□ 3.92
EFCAB2Q5VUJ9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
EFCAB2Q5VUJ9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
EFCAB2Q5VUJ9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC39.53■■■■□ 3.92
EFCAB2Q5VUJ9 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC39.51■■■■□ 3.92
EFCAB2Q5VUJ9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC39.51■■■■□ 3.92
EFCAB2Q5VUJ9 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC39.51■■■■□ 3.92
EFCAB2Q5VUJ9 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
EFCAB2Q5VUJ9 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.5■■■■□ 3.91
EFCAB2Q5VUJ9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC39.48■■■■□ 3.91
EFCAB2Q5VUJ9 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC39.48■■■■□ 3.91
EFCAB2Q5VUJ9 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC39.48■■■■□ 3.91
EFCAB2Q5VUJ9 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC39.47■■■■□ 3.91
EFCAB2Q5VUJ9 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
EFCAB2Q5VUJ9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
EFCAB2Q5VUJ9 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
EFCAB2Q5VUJ9 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC39.45■■■■□ 3.91
EFCAB2Q5VUJ9 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
EFCAB2Q5VUJ9 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC39.44■■■■□ 3.9
EFCAB2Q5VUJ9 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
EFCAB2Q5VUJ9 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
EFCAB2Q5VUJ9 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC39.43■■■■□ 3.9
EFCAB2Q5VUJ9 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC39.43■■■■□ 3.9
EFCAB2Q5VUJ9 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC39.42■■■■□ 3.9
EFCAB2Q5VUJ9 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC39.42■■■■□ 3.9
EFCAB2Q5VUJ9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC39.41■■■■□ 3.9
EFCAB2Q5VUJ9 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
EFCAB2Q5VUJ9 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
EFCAB2Q5VUJ9 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
EFCAB2Q5VUJ9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
EFCAB2Q5VUJ9 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC39.4■■■■□ 3.9
EFCAB2Q5VUJ9 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
EFCAB2Q5VUJ9 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
EFCAB2Q5VUJ9 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
EFCAB2Q5VUJ9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.39■■■■□ 3.9
EFCAB2Q5VUJ9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.39■■■■□ 3.9
EFCAB2Q5VUJ9 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
EFCAB2Q5VUJ9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.9
EFCAB2Q5VUJ9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.9
EFCAB2Q5VUJ9 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.38■■■■□ 3.89
EFCAB2Q5VUJ9 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC39.37■■■■□ 3.89
EFCAB2Q5VUJ9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC39.37■■■■□ 3.89
EFCAB2Q5VUJ9 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC39.37■■■■□ 3.89
EFCAB2Q5VUJ9 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC39.36■■■■□ 3.89
EFCAB2Q5VUJ9 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC39.36■■■■□ 3.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms