Protein–RNA interactions for Protein: Q5T6S3

PHF19, PHD finger protein 19, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF19Q5T6S3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PHF19Q5T6S3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PHF19Q5T6S3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PHF19Q5T6S3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PHF19Q5T6S3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PHF19Q5T6S3 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PHF19Q5T6S3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PHF19Q5T6S3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PHF19Q5T6S3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PHF19Q5T6S3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PHF19Q5T6S3 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PHF19Q5T6S3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PHF19Q5T6S3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PHF19Q5T6S3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PHF19Q5T6S3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PHF19Q5T6S3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PHF19Q5T6S3 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PHF19Q5T6S3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PHF19Q5T6S3 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PHF19Q5T6S3 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PHF19Q5T6S3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PHF19Q5T6S3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PHF19Q5T6S3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PHF19Q5T6S3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PHF19Q5T6S3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PHF19Q5T6S3 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PHF19Q5T6S3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PHF19Q5T6S3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PHF19Q5T6S3 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PHF19Q5T6S3 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PHF19Q5T6S3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PHF19Q5T6S3 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PHF19Q5T6S3 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PHF19Q5T6S3 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PHF19Q5T6S3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PHF19Q5T6S3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PHF19Q5T6S3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PHF19Q5T6S3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PHF19Q5T6S3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PHF19Q5T6S3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PHF19Q5T6S3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PHF19Q5T6S3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PHF19Q5T6S3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PHF19Q5T6S3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PHF19Q5T6S3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PHF19Q5T6S3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PHF19Q5T6S3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PHF19Q5T6S3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PHF19Q5T6S3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PHF19Q5T6S3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PHF19Q5T6S3 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PHF19Q5T6S3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PHF19Q5T6S3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PHF19Q5T6S3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PHF19Q5T6S3 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PHF19Q5T6S3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PHF19Q5T6S3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PHF19Q5T6S3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PHF19Q5T6S3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PHF19Q5T6S3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PHF19Q5T6S3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PHF19Q5T6S3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PHF19Q5T6S3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PHF19Q5T6S3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PHF19Q5T6S3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PHF19Q5T6S3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PHF19Q5T6S3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PHF19Q5T6S3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PHF19Q5T6S3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PHF19Q5T6S3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PHF19Q5T6S3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PHF19Q5T6S3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PHF19Q5T6S3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PHF19Q5T6S3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PHF19Q5T6S3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PHF19Q5T6S3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PHF19Q5T6S3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PHF19Q5T6S3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PHF19Q5T6S3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PHF19Q5T6S3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PHF19Q5T6S3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PHF19Q5T6S3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PHF19Q5T6S3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PHF19Q5T6S3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PHF19Q5T6S3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PHF19Q5T6S3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PHF19Q5T6S3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PHF19Q5T6S3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PHF19Q5T6S3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PHF19Q5T6S3 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PHF19Q5T6S3 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PHF19Q5T6S3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PHF19Q5T6S3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PHF19Q5T6S3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PHF19Q5T6S3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PHF19Q5T6S3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PHF19Q5T6S3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PHF19Q5T6S3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PHF19Q5T6S3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PHF19Q5T6S3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms