Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE7

PHYHD1, Phytanoyl-CoA dioxygenase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHYHD1Q5SRE7 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHYHD1Q5SRE7 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
PHYHD1Q5SRE7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHYHD1Q5SRE7 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHYHD1Q5SRE7 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHYHD1Q5SRE7 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHYHD1Q5SRE7 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHYHD1Q5SRE7 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHYHD1Q5SRE7 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHYHD1Q5SRE7 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHYHD1Q5SRE7 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHYHD1Q5SRE7 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHYHD1Q5SRE7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHYHD1Q5SRE7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHYHD1Q5SRE7 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHYHD1Q5SRE7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHYHD1Q5SRE7 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHYHD1Q5SRE7 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHYHD1Q5SRE7 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHYHD1Q5SRE7 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHYHD1Q5SRE7 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHYHD1Q5SRE7 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHYHD1Q5SRE7 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHYHD1Q5SRE7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHYHD1Q5SRE7 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHYHD1Q5SRE7 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PHYHD1Q5SRE7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHYHD1Q5SRE7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHYHD1Q5SRE7 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHYHD1Q5SRE7 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHYHD1Q5SRE7 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHYHD1Q5SRE7 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHYHD1Q5SRE7 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHYHD1Q5SRE7 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHYHD1Q5SRE7 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHYHD1Q5SRE7 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHYHD1Q5SRE7 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHYHD1Q5SRE7 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHYHD1Q5SRE7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PHYHD1Q5SRE7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PHYHD1Q5SRE7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
PHYHD1Q5SRE7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PHYHD1Q5SRE7 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PHYHD1Q5SRE7 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PHYHD1Q5SRE7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PHYHD1Q5SRE7 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PHYHD1Q5SRE7 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PHYHD1Q5SRE7 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHYHD1Q5SRE7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHYHD1Q5SRE7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHYHD1Q5SRE7 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHYHD1Q5SRE7 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHYHD1Q5SRE7 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHYHD1Q5SRE7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHYHD1Q5SRE7 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHYHD1Q5SRE7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHYHD1Q5SRE7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHYHD1Q5SRE7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PHYHD1Q5SRE7 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PHYHD1Q5SRE7 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PHYHD1Q5SRE7 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PHYHD1Q5SRE7 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHYHD1Q5SRE7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHYHD1Q5SRE7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHYHD1Q5SRE7 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PHYHD1Q5SRE7 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PHYHD1Q5SRE7 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHYHD1Q5SRE7 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHYHD1Q5SRE7 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHYHD1Q5SRE7 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PHYHD1Q5SRE7 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHYHD1Q5SRE7 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHYHD1Q5SRE7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHYHD1Q5SRE7 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHYHD1Q5SRE7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHYHD1Q5SRE7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHYHD1Q5SRE7 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHYHD1Q5SRE7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHYHD1Q5SRE7 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PHYHD1Q5SRE7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHYHD1Q5SRE7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHYHD1Q5SRE7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHYHD1Q5SRE7 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHYHD1Q5SRE7 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PHYHD1Q5SRE7 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHYHD1Q5SRE7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHYHD1Q5SRE7 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHYHD1Q5SRE7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PHYHD1Q5SRE7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PHYHD1Q5SRE7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PHYHD1Q5SRE7 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHYHD1Q5SRE7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHYHD1Q5SRE7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHYHD1Q5SRE7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHYHD1Q5SRE7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHYHD1Q5SRE7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PHYHD1Q5SRE7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PHYHD1Q5SRE7 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PHYHD1Q5SRE7 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PHYHD1Q5SRE7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms