Protein–RNA interactions for Protein: Q5GJ75

TNFAIP8L3, Tumor necrosis factor alpha-induced protein 8-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFAIP8L3Q5GJ75 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TNFAIP8L3Q5GJ75 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TNFAIP8L3Q5GJ75 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TNFAIP8L3Q5GJ75 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TNFAIP8L3Q5GJ75 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TNFAIP8L3Q5GJ75 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TNFAIP8L3Q5GJ75 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TNFAIP8L3Q5GJ75 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
TNFAIP8L3Q5GJ75 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TNFAIP8L3Q5GJ75 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TNFAIP8L3Q5GJ75 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
TNFAIP8L3Q5GJ75 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TNFAIP8L3Q5GJ75 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TNFAIP8L3Q5GJ75 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TNFAIP8L3Q5GJ75 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TNFAIP8L3Q5GJ75 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TNFAIP8L3Q5GJ75 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TNFAIP8L3Q5GJ75 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TNFAIP8L3Q5GJ75 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TNFAIP8L3Q5GJ75 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TNFAIP8L3Q5GJ75 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TNFAIP8L3Q5GJ75 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TNFAIP8L3Q5GJ75 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TNFAIP8L3Q5GJ75 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TNFAIP8L3Q5GJ75 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TNFAIP8L3Q5GJ75 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TNFAIP8L3Q5GJ75 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TNFAIP8L3Q5GJ75 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TNFAIP8L3Q5GJ75 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNFAIP8L3Q5GJ75 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNFAIP8L3Q5GJ75 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
TNFAIP8L3Q5GJ75 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TNFAIP8L3Q5GJ75 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TNFAIP8L3Q5GJ75 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TNFAIP8L3Q5GJ75 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TNFAIP8L3Q5GJ75 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TNFAIP8L3Q5GJ75 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
TNFAIP8L3Q5GJ75 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNFAIP8L3Q5GJ75 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
TNFAIP8L3Q5GJ75 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNFAIP8L3Q5GJ75 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNFAIP8L3Q5GJ75 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNFAIP8L3Q5GJ75 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNFAIP8L3Q5GJ75 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TNFAIP8L3Q5GJ75 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TNFAIP8L3Q5GJ75 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TNFAIP8L3Q5GJ75 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TNFAIP8L3Q5GJ75 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TNFAIP8L3Q5GJ75 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TNFAIP8L3Q5GJ75 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TNFAIP8L3Q5GJ75 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TNFAIP8L3Q5GJ75 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TNFAIP8L3Q5GJ75 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TNFAIP8L3Q5GJ75 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
TNFAIP8L3Q5GJ75 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TNFAIP8L3Q5GJ75 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TNFAIP8L3Q5GJ75 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TNFAIP8L3Q5GJ75 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TNFAIP8L3Q5GJ75 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TNFAIP8L3Q5GJ75 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TNFAIP8L3Q5GJ75 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TNFAIP8L3Q5GJ75 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TNFAIP8L3Q5GJ75 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TNFAIP8L3Q5GJ75 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TNFAIP8L3Q5GJ75 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
TNFAIP8L3Q5GJ75 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TNFAIP8L3Q5GJ75 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TNFAIP8L3Q5GJ75 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TNFAIP8L3Q5GJ75 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TNFAIP8L3Q5GJ75 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TNFAIP8L3Q5GJ75 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TNFAIP8L3Q5GJ75 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TNFAIP8L3Q5GJ75 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TNFAIP8L3Q5GJ75 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TNFAIP8L3Q5GJ75 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TNFAIP8L3Q5GJ75 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TNFAIP8L3Q5GJ75 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TNFAIP8L3Q5GJ75 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TNFAIP8L3Q5GJ75 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TNFAIP8L3Q5GJ75 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TNFAIP8L3Q5GJ75 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TNFAIP8L3Q5GJ75 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TNFAIP8L3Q5GJ75 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TNFAIP8L3Q5GJ75 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TNFAIP8L3Q5GJ75 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TNFAIP8L3Q5GJ75 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TNFAIP8L3Q5GJ75 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TNFAIP8L3Q5GJ75 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TNFAIP8L3Q5GJ75 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TNFAIP8L3Q5GJ75 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TNFAIP8L3Q5GJ75 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TNFAIP8L3Q5GJ75 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TNFAIP8L3Q5GJ75 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TNFAIP8L3Q5GJ75 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TNFAIP8L3Q5GJ75 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
TNFAIP8L3Q5GJ75 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TNFAIP8L3Q5GJ75 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TNFAIP8L3Q5GJ75 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TNFAIP8L3Q5GJ75 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TNFAIP8L3Q5GJ75 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms