Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SDK2Q58EX2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SDK2Q58EX2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SDK2Q58EX2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SDK2Q58EX2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SDK2Q58EX2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SDK2Q58EX2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SDK2Q58EX2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SDK2Q58EX2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SDK2Q58EX2 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SDK2Q58EX2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SDK2Q58EX2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SDK2Q58EX2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SDK2Q58EX2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SDK2Q58EX2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SDK2Q58EX2 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SDK2Q58EX2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SDK2Q58EX2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SDK2Q58EX2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SDK2Q58EX2 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SDK2Q58EX2 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SDK2Q58EX2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SDK2Q58EX2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SDK2Q58EX2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SDK2Q58EX2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SDK2Q58EX2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SDK2Q58EX2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SDK2Q58EX2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SDK2Q58EX2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SDK2Q58EX2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SDK2Q58EX2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SDK2Q58EX2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SDK2Q58EX2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SDK2Q58EX2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SDK2Q58EX2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SDK2Q58EX2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SDK2Q58EX2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SDK2Q58EX2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SDK2Q58EX2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SDK2Q58EX2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SDK2Q58EX2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SDK2Q58EX2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SDK2Q58EX2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SDK2Q58EX2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SDK2Q58EX2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SDK2Q58EX2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SDK2Q58EX2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SDK2Q58EX2 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SDK2Q58EX2 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SDK2Q58EX2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SDK2Q58EX2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SDK2Q58EX2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SDK2Q58EX2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SDK2Q58EX2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SDK2Q58EX2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SDK2Q58EX2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SDK2Q58EX2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SDK2Q58EX2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SDK2Q58EX2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SDK2Q58EX2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SDK2Q58EX2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SDK2Q58EX2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SDK2Q58EX2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SDK2Q58EX2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SDK2Q58EX2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SDK2Q58EX2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SDK2Q58EX2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SDK2Q58EX2 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SDK2Q58EX2 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SDK2Q58EX2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SDK2Q58EX2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SDK2Q58EX2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SDK2Q58EX2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SDK2Q58EX2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SDK2Q58EX2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SDK2Q58EX2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SDK2Q58EX2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SDK2Q58EX2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SDK2Q58EX2 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SDK2Q58EX2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SDK2Q58EX2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SDK2Q58EX2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SDK2Q58EX2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SDK2Q58EX2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SDK2Q58EX2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SDK2Q58EX2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SDK2Q58EX2 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SDK2Q58EX2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SDK2Q58EX2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SDK2Q58EX2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SDK2Q58EX2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SDK2Q58EX2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SDK2Q58EX2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SDK2Q58EX2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SDK2Q58EX2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SDK2Q58EX2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SDK2Q58EX2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SDK2Q58EX2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SDK2Q58EX2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SDK2Q58EX2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms