Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
C4orf17Q53FE4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C4orf17Q53FE4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C4orf17Q53FE4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C4orf17Q53FE4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C4orf17Q53FE4 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C4orf17Q53FE4 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C4orf17Q53FE4 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C4orf17Q53FE4 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C4orf17Q53FE4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C4orf17Q53FE4 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C4orf17Q53FE4 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C4orf17Q53FE4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C4orf17Q53FE4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C4orf17Q53FE4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C4orf17Q53FE4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C4orf17Q53FE4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C4orf17Q53FE4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C4orf17Q53FE4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C4orf17Q53FE4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C4orf17Q53FE4 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C4orf17Q53FE4 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
C4orf17Q53FE4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C4orf17Q53FE4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C4orf17Q53FE4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
C4orf17Q53FE4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
C4orf17Q53FE4 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
C4orf17Q53FE4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C4orf17Q53FE4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C4orf17Q53FE4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C4orf17Q53FE4 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C4orf17Q53FE4 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C4orf17Q53FE4 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C4orf17Q53FE4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C4orf17Q53FE4 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C4orf17Q53FE4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C4orf17Q53FE4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
C4orf17Q53FE4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
C4orf17Q53FE4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
C4orf17Q53FE4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C4orf17Q53FE4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C4orf17Q53FE4 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
C4orf17Q53FE4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
C4orf17Q53FE4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C4orf17Q53FE4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C4orf17Q53FE4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C4orf17Q53FE4 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C4orf17Q53FE4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
C4orf17Q53FE4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
C4orf17Q53FE4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
C4orf17Q53FE4 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
C4orf17Q53FE4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
C4orf17Q53FE4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
C4orf17Q53FE4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
C4orf17Q53FE4 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C4orf17Q53FE4 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C4orf17Q53FE4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C4orf17Q53FE4 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
C4orf17Q53FE4 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C4orf17Q53FE4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
C4orf17Q53FE4 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C4orf17Q53FE4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C4orf17Q53FE4 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C4orf17Q53FE4 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C4orf17Q53FE4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C4orf17Q53FE4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C4orf17Q53FE4 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C4orf17Q53FE4 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C4orf17Q53FE4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C4orf17Q53FE4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
C4orf17Q53FE4 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C4orf17Q53FE4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C4orf17Q53FE4 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C4orf17Q53FE4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
C4orf17Q53FE4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C4orf17Q53FE4 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C4orf17Q53FE4 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C4orf17Q53FE4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C4orf17Q53FE4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C4orf17Q53FE4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C4orf17Q53FE4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C4orf17Q53FE4 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C4orf17Q53FE4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C4orf17Q53FE4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
C4orf17Q53FE4 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C4orf17Q53FE4 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C4orf17Q53FE4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C4orf17Q53FE4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
C4orf17Q53FE4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C4orf17Q53FE4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
C4orf17Q53FE4 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C4orf17Q53FE4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C4orf17Q53FE4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C4orf17Q53FE4 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
C4orf17Q53FE4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
C4orf17Q53FE4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
C4orf17Q53FE4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
C4orf17Q53FE4 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
C4orf17Q53FE4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
C4orf17Q53FE4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms