Protein–RNA interactions for Protein: Q502W6

VWA3B, von Willebrand factor A domain-containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3BQ502W6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
VWA3BQ502W6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
VWA3BQ502W6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
VWA3BQ502W6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
VWA3BQ502W6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
VWA3BQ502W6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
VWA3BQ502W6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
VWA3BQ502W6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
VWA3BQ502W6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
VWA3BQ502W6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
VWA3BQ502W6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
VWA3BQ502W6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
VWA3BQ502W6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
VWA3BQ502W6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
VWA3BQ502W6 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28■■■□□ 2.07
VWA3BQ502W6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
VWA3BQ502W6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
VWA3BQ502W6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
VWA3BQ502W6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
VWA3BQ502W6 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
VWA3BQ502W6 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
VWA3BQ502W6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
VWA3BQ502W6 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
VWA3BQ502W6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
VWA3BQ502W6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
VWA3BQ502W6 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
VWA3BQ502W6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
VWA3BQ502W6 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
VWA3BQ502W6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
VWA3BQ502W6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
VWA3BQ502W6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
VWA3BQ502W6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
VWA3BQ502W6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
VWA3BQ502W6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
VWA3BQ502W6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
VWA3BQ502W6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
VWA3BQ502W6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
VWA3BQ502W6 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
VWA3BQ502W6 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
VWA3BQ502W6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
VWA3BQ502W6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
VWA3BQ502W6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
VWA3BQ502W6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
VWA3BQ502W6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
VWA3BQ502W6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
VWA3BQ502W6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
VWA3BQ502W6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
VWA3BQ502W6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
VWA3BQ502W6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
VWA3BQ502W6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
VWA3BQ502W6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
VWA3BQ502W6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
VWA3BQ502W6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
VWA3BQ502W6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
VWA3BQ502W6 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
VWA3BQ502W6 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
VWA3BQ502W6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
VWA3BQ502W6 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
VWA3BQ502W6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
VWA3BQ502W6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
VWA3BQ502W6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
VWA3BQ502W6 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
VWA3BQ502W6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
VWA3BQ502W6 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
VWA3BQ502W6 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
VWA3BQ502W6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
VWA3BQ502W6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
VWA3BQ502W6 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
VWA3BQ502W6 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
VWA3BQ502W6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
VWA3BQ502W6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
VWA3BQ502W6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
VWA3BQ502W6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
VWA3BQ502W6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
VWA3BQ502W6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
VWA3BQ502W6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
VWA3BQ502W6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
VWA3BQ502W6 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
VWA3BQ502W6 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
VWA3BQ502W6 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
VWA3BQ502W6 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
VWA3BQ502W6 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
VWA3BQ502W6 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
VWA3BQ502W6 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
VWA3BQ502W6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
VWA3BQ502W6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
VWA3BQ502W6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
VWA3BQ502W6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
VWA3BQ502W6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
VWA3BQ502W6 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
VWA3BQ502W6 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
VWA3BQ502W6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
VWA3BQ502W6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
VWA3BQ502W6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
VWA3BQ502W6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
VWA3BQ502W6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
VWA3BQ502W6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
VWA3BQ502W6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
VWA3BQ502W6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
VWA3BQ502W6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms