Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZG55

GREB1, Protein GREB1, humanhuman

Predictions only

Length 1,949 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GREB1Q4ZG55 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GREB1Q4ZG55 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GREB1Q4ZG55 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GREB1Q4ZG55 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GREB1Q4ZG55 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
GREB1Q4ZG55 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GREB1Q4ZG55 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GREB1Q4ZG55 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GREB1Q4ZG55 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GREB1Q4ZG55 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GREB1Q4ZG55 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GREB1Q4ZG55 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GREB1Q4ZG55 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GREB1Q4ZG55 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GREB1Q4ZG55 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GREB1Q4ZG55 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GREB1Q4ZG55 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GREB1Q4ZG55 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GREB1Q4ZG55 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GREB1Q4ZG55 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GREB1Q4ZG55 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GREB1Q4ZG55 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GREB1Q4ZG55 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GREB1Q4ZG55 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GREB1Q4ZG55 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GREB1Q4ZG55 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GREB1Q4ZG55 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GREB1Q4ZG55 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GREB1Q4ZG55 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
GREB1Q4ZG55 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GREB1Q4ZG55 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GREB1Q4ZG55 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GREB1Q4ZG55 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GREB1Q4ZG55 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GREB1Q4ZG55 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GREB1Q4ZG55 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GREB1Q4ZG55 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GREB1Q4ZG55 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GREB1Q4ZG55 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GREB1Q4ZG55 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GREB1Q4ZG55 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GREB1Q4ZG55 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GREB1Q4ZG55 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GREB1Q4ZG55 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GREB1Q4ZG55 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GREB1Q4ZG55 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GREB1Q4ZG55 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GREB1Q4ZG55 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
GREB1Q4ZG55 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GREB1Q4ZG55 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GREB1Q4ZG55 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GREB1Q4ZG55 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GREB1Q4ZG55 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GREB1Q4ZG55 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GREB1Q4ZG55 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GREB1Q4ZG55 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GREB1Q4ZG55 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GREB1Q4ZG55 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GREB1Q4ZG55 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
GREB1Q4ZG55 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GREB1Q4ZG55 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GREB1Q4ZG55 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GREB1Q4ZG55 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GREB1Q4ZG55 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GREB1Q4ZG55 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GREB1Q4ZG55 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GREB1Q4ZG55 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GREB1Q4ZG55 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GREB1Q4ZG55 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GREB1Q4ZG55 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GREB1Q4ZG55 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GREB1Q4ZG55 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GREB1Q4ZG55 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GREB1Q4ZG55 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GREB1Q4ZG55 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GREB1Q4ZG55 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GREB1Q4ZG55 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GREB1Q4ZG55 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GREB1Q4ZG55 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GREB1Q4ZG55 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GREB1Q4ZG55 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GREB1Q4ZG55 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GREB1Q4ZG55 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GREB1Q4ZG55 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GREB1Q4ZG55 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GREB1Q4ZG55 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GREB1Q4ZG55 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GREB1Q4ZG55 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
GREB1Q4ZG55 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GREB1Q4ZG55 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GREB1Q4ZG55 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GREB1Q4ZG55 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GREB1Q4ZG55 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
GREB1Q4ZG55 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GREB1Q4ZG55 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GREB1Q4ZG55 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GREB1Q4ZG55 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
GREB1Q4ZG55 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GREB1Q4ZG55 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GREB1Q4ZG55 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.5 ms