Protein–RNA interactions for Protein: Q494V2

CFAP100, Cilia- and flagella-associated protein 100, humanhuman

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Length 611 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP100Q494V2 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
CFAP100Q494V2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC31.2■■■□□ 2.58
CFAP100Q494V2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
CFAP100Q494V2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
CFAP100Q494V2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
CFAP100Q494V2 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
CFAP100Q494V2 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
CFAP100Q494V2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
CFAP100Q494V2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
CFAP100Q494V2 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
CFAP100Q494V2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
CFAP100Q494V2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
CFAP100Q494V2 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
CFAP100Q494V2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
CFAP100Q494V2 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
CFAP100Q494V2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
CFAP100Q494V2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
CFAP100Q494V2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
CFAP100Q494V2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
CFAP100Q494V2 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
CFAP100Q494V2 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
CFAP100Q494V2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
CFAP100Q494V2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
CFAP100Q494V2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
CFAP100Q494V2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
CFAP100Q494V2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
CFAP100Q494V2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
CFAP100Q494V2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC31.11■■■□□ 2.57
CFAP100Q494V2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
CFAP100Q494V2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
CFAP100Q494V2 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
CFAP100Q494V2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
CFAP100Q494V2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
CFAP100Q494V2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
CFAP100Q494V2 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
CFAP100Q494V2 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
CFAP100Q494V2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC31.09■■■□□ 2.57
CFAP100Q494V2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.09■■■□□ 2.57
CFAP100Q494V2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
CFAP100Q494V2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
CFAP100Q494V2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
CFAP100Q494V2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
CFAP100Q494V2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
CFAP100Q494V2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
CFAP100Q494V2 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
CFAP100Q494V2 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
CFAP100Q494V2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
CFAP100Q494V2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC31.03■■■□□ 2.56
CFAP100Q494V2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
CFAP100Q494V2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
CFAP100Q494V2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
CFAP100Q494V2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
CFAP100Q494V2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
CFAP100Q494V2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
CFAP100Q494V2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
CFAP100Q494V2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.55
CFAP100Q494V2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
CFAP100Q494V2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
CFAP100Q494V2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
CFAP100Q494V2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CFAP100Q494V2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
CFAP100Q494V2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CFAP100Q494V2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
CFAP100Q494V2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
CFAP100Q494V2 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC30.99■■■□□ 2.55
CFAP100Q494V2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
CFAP100Q494V2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
CFAP100Q494V2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
CFAP100Q494V2 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
CFAP100Q494V2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
CFAP100Q494V2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
CFAP100Q494V2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
CFAP100Q494V2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.55
CFAP100Q494V2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
CFAP100Q494V2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CFAP100Q494V2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CFAP100Q494V2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
CFAP100Q494V2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
CFAP100Q494V2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
CFAP100Q494V2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
CFAP100Q494V2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
CFAP100Q494V2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
CFAP100Q494V2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
CFAP100Q494V2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CFAP100Q494V2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC30.89■■■□□ 2.54
CFAP100Q494V2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
CFAP100Q494V2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
CFAP100Q494V2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
CFAP100Q494V2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
CFAP100Q494V2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
CFAP100Q494V2 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
CFAP100Q494V2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
CFAP100Q494V2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
CFAP100Q494V2 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
CFAP100Q494V2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CFAP100Q494V2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC30.86■■■□□ 2.53
CFAP100Q494V2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.86■■■□□ 2.53
CFAP100Q494V2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
CFAP100Q494V2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
CFAP100Q494V2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
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