Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZM63

ETDB, Embryonic testis differentiation homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 59 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETDBQ3ZM63 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ETDBQ3ZM63 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ETDBQ3ZM63 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ETDBQ3ZM63 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ETDBQ3ZM63 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ETDBQ3ZM63 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ETDBQ3ZM63 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ETDBQ3ZM63 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ETDBQ3ZM63 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ETDBQ3ZM63 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ETDBQ3ZM63 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ETDBQ3ZM63 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ETDBQ3ZM63 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ETDBQ3ZM63 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ETDBQ3ZM63 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ETDBQ3ZM63 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ETDBQ3ZM63 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ETDBQ3ZM63 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ETDBQ3ZM63 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ETDBQ3ZM63 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ETDBQ3ZM63 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ETDBQ3ZM63 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ETDBQ3ZM63 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ETDBQ3ZM63 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ETDBQ3ZM63 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ETDBQ3ZM63 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ETDBQ3ZM63 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ETDBQ3ZM63 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ETDBQ3ZM63 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ETDBQ3ZM63 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ETDBQ3ZM63 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ETDBQ3ZM63 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ETDBQ3ZM63 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ETDBQ3ZM63 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ETDBQ3ZM63 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ETDBQ3ZM63 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ETDBQ3ZM63 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ETDBQ3ZM63 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ETDBQ3ZM63 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ETDBQ3ZM63 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ETDBQ3ZM63 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ETDBQ3ZM63 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ETDBQ3ZM63 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ETDBQ3ZM63 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ETDBQ3ZM63 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ETDBQ3ZM63 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ETDBQ3ZM63 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ETDBQ3ZM63 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ETDBQ3ZM63 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ETDBQ3ZM63 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ETDBQ3ZM63 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ETDBQ3ZM63 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ETDBQ3ZM63 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ETDBQ3ZM63 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ETDBQ3ZM63 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ETDBQ3ZM63 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ETDBQ3ZM63 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ETDBQ3ZM63 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ETDBQ3ZM63 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ETDBQ3ZM63 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ETDBQ3ZM63 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ETDBQ3ZM63 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ETDBQ3ZM63 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ETDBQ3ZM63 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ETDBQ3ZM63 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ETDBQ3ZM63 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ETDBQ3ZM63 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ETDBQ3ZM63 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ETDBQ3ZM63 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ETDBQ3ZM63 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ETDBQ3ZM63 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ETDBQ3ZM63 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ETDBQ3ZM63 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ETDBQ3ZM63 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ETDBQ3ZM63 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ETDBQ3ZM63 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ETDBQ3ZM63 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ETDBQ3ZM63 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ETDBQ3ZM63 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ETDBQ3ZM63 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ETDBQ3ZM63 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ETDBQ3ZM63 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ETDBQ3ZM63 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ETDBQ3ZM63 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ETDBQ3ZM63 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ETDBQ3ZM63 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ETDBQ3ZM63 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ETDBQ3ZM63 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ETDBQ3ZM63 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ETDBQ3ZM63 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ETDBQ3ZM63 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ETDBQ3ZM63 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ETDBQ3ZM63 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ETDBQ3ZM63 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ETDBQ3ZM63 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ETDBQ3ZM63 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ETDBQ3ZM63 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ETDBQ3ZM63 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ETDBQ3ZM63 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ETDBQ3ZM63 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms