Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7I2

CNPY1, Protein canopy homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNPY1Q3B7I2 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNPY1Q3B7I2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNPY1Q3B7I2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNPY1Q3B7I2 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNPY1Q3B7I2 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNPY1Q3B7I2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNPY1Q3B7I2 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNPY1Q3B7I2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNPY1Q3B7I2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNPY1Q3B7I2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNPY1Q3B7I2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNPY1Q3B7I2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CNPY1Q3B7I2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CNPY1Q3B7I2 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CNPY1Q3B7I2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CNPY1Q3B7I2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CNPY1Q3B7I2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNPY1Q3B7I2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNPY1Q3B7I2 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNPY1Q3B7I2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNPY1Q3B7I2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNPY1Q3B7I2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNPY1Q3B7I2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNPY1Q3B7I2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNPY1Q3B7I2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNPY1Q3B7I2 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNPY1Q3B7I2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNPY1Q3B7I2 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNPY1Q3B7I2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNPY1Q3B7I2 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNPY1Q3B7I2 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNPY1Q3B7I2 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNPY1Q3B7I2 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNPY1Q3B7I2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNPY1Q3B7I2 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNPY1Q3B7I2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNPY1Q3B7I2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CNPY1Q3B7I2 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CNPY1Q3B7I2 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CNPY1Q3B7I2 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CNPY1Q3B7I2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNPY1Q3B7I2 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNPY1Q3B7I2 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNPY1Q3B7I2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNPY1Q3B7I2 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNPY1Q3B7I2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNPY1Q3B7I2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNPY1Q3B7I2 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNPY1Q3B7I2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNPY1Q3B7I2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNPY1Q3B7I2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNPY1Q3B7I2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNPY1Q3B7I2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNPY1Q3B7I2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNPY1Q3B7I2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNPY1Q3B7I2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNPY1Q3B7I2 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNPY1Q3B7I2 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNPY1Q3B7I2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNPY1Q3B7I2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNPY1Q3B7I2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNPY1Q3B7I2 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNPY1Q3B7I2 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CNPY1Q3B7I2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNPY1Q3B7I2 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNPY1Q3B7I2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNPY1Q3B7I2 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNPY1Q3B7I2 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNPY1Q3B7I2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNPY1Q3B7I2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNPY1Q3B7I2 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNPY1Q3B7I2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNPY1Q3B7I2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNPY1Q3B7I2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNPY1Q3B7I2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNPY1Q3B7I2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNPY1Q3B7I2 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNPY1Q3B7I2 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNPY1Q3B7I2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNPY1Q3B7I2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNPY1Q3B7I2 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNPY1Q3B7I2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNPY1Q3B7I2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNPY1Q3B7I2 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CNPY1Q3B7I2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNPY1Q3B7I2 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNPY1Q3B7I2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CNPY1Q3B7I2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CNPY1Q3B7I2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNPY1Q3B7I2 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNPY1Q3B7I2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNPY1Q3B7I2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNPY1Q3B7I2 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNPY1Q3B7I2 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNPY1Q3B7I2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNPY1Q3B7I2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNPY1Q3B7I2 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNPY1Q3B7I2 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNPY1Q3B7I2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNPY1Q3B7I2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms