Protein–RNA interactions for Protein: Q1ZZU3

SWI5, DNA repair protein SWI5 homolog, humanhuman

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Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SWI5Q1ZZU3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SWI5Q1ZZU3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SWI5Q1ZZU3 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SWI5Q1ZZU3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SWI5Q1ZZU3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SWI5Q1ZZU3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SWI5Q1ZZU3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SWI5Q1ZZU3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SWI5Q1ZZU3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SWI5Q1ZZU3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SWI5Q1ZZU3 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SWI5Q1ZZU3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SWI5Q1ZZU3 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SWI5Q1ZZU3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SWI5Q1ZZU3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SWI5Q1ZZU3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SWI5Q1ZZU3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SWI5Q1ZZU3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SWI5Q1ZZU3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SWI5Q1ZZU3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SWI5Q1ZZU3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SWI5Q1ZZU3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SWI5Q1ZZU3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SWI5Q1ZZU3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SWI5Q1ZZU3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SWI5Q1ZZU3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SWI5Q1ZZU3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SWI5Q1ZZU3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SWI5Q1ZZU3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SWI5Q1ZZU3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SWI5Q1ZZU3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SWI5Q1ZZU3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SWI5Q1ZZU3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SWI5Q1ZZU3 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SWI5Q1ZZU3 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SWI5Q1ZZU3 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SWI5Q1ZZU3 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SWI5Q1ZZU3 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SWI5Q1ZZU3 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SWI5Q1ZZU3 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SWI5Q1ZZU3 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SWI5Q1ZZU3 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SWI5Q1ZZU3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SWI5Q1ZZU3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SWI5Q1ZZU3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SWI5Q1ZZU3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SWI5Q1ZZU3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SWI5Q1ZZU3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SWI5Q1ZZU3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SWI5Q1ZZU3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SWI5Q1ZZU3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SWI5Q1ZZU3 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SWI5Q1ZZU3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SWI5Q1ZZU3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SWI5Q1ZZU3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SWI5Q1ZZU3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SWI5Q1ZZU3 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SWI5Q1ZZU3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SWI5Q1ZZU3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SWI5Q1ZZU3 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SWI5Q1ZZU3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SWI5Q1ZZU3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SWI5Q1ZZU3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SWI5Q1ZZU3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SWI5Q1ZZU3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SWI5Q1ZZU3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SWI5Q1ZZU3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SWI5Q1ZZU3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SWI5Q1ZZU3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SWI5Q1ZZU3 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SWI5Q1ZZU3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SWI5Q1ZZU3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SWI5Q1ZZU3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SWI5Q1ZZU3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SWI5Q1ZZU3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SWI5Q1ZZU3 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SWI5Q1ZZU3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SWI5Q1ZZU3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SWI5Q1ZZU3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SWI5Q1ZZU3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SWI5Q1ZZU3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SWI5Q1ZZU3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SWI5Q1ZZU3 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SWI5Q1ZZU3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SWI5Q1ZZU3 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SWI5Q1ZZU3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SWI5Q1ZZU3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SWI5Q1ZZU3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SWI5Q1ZZU3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SWI5Q1ZZU3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SWI5Q1ZZU3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SWI5Q1ZZU3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SWI5Q1ZZU3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SWI5Q1ZZU3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SWI5Q1ZZU3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SWI5Q1ZZU3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SWI5Q1ZZU3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SWI5Q1ZZU3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SWI5Q1ZZU3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SWI5Q1ZZU3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
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