Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
KNOP1Q1ED39 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
KNOP1Q1ED39 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KNOP1Q1ED39 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
KNOP1Q1ED39 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KNOP1Q1ED39 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
KNOP1Q1ED39 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KNOP1Q1ED39 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KNOP1Q1ED39 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
KNOP1Q1ED39 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
KNOP1Q1ED39 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
KNOP1Q1ED39 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
KNOP1Q1ED39 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
KNOP1Q1ED39 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
KNOP1Q1ED39 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
KNOP1Q1ED39 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
KNOP1Q1ED39 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
KNOP1Q1ED39 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
KNOP1Q1ED39 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
KNOP1Q1ED39 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
KNOP1Q1ED39 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
KNOP1Q1ED39 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
KNOP1Q1ED39 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
KNOP1Q1ED39 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
KNOP1Q1ED39 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
KNOP1Q1ED39 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
KNOP1Q1ED39 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
KNOP1Q1ED39 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
KNOP1Q1ED39 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
KNOP1Q1ED39 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
KNOP1Q1ED39 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
KNOP1Q1ED39 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
KNOP1Q1ED39 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
KNOP1Q1ED39 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
KNOP1Q1ED39 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
KNOP1Q1ED39 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
KNOP1Q1ED39 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
KNOP1Q1ED39 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
KNOP1Q1ED39 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
KNOP1Q1ED39 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
KNOP1Q1ED39 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
KNOP1Q1ED39 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
KNOP1Q1ED39 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
KNOP1Q1ED39 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
KNOP1Q1ED39 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
KNOP1Q1ED39 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
KNOP1Q1ED39 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
KNOP1Q1ED39 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
KNOP1Q1ED39 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
KNOP1Q1ED39 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
KNOP1Q1ED39 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
KNOP1Q1ED39 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
KNOP1Q1ED39 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
KNOP1Q1ED39 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
KNOP1Q1ED39 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
KNOP1Q1ED39 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
KNOP1Q1ED39 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
KNOP1Q1ED39 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
KNOP1Q1ED39 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
KNOP1Q1ED39 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KNOP1Q1ED39 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
KNOP1Q1ED39 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
KNOP1Q1ED39 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
KNOP1Q1ED39 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
KNOP1Q1ED39 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
KNOP1Q1ED39 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
KNOP1Q1ED39 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
KNOP1Q1ED39 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
KNOP1Q1ED39 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
KNOP1Q1ED39 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
KNOP1Q1ED39 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
KNOP1Q1ED39 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KNOP1Q1ED39 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
KNOP1Q1ED39 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
KNOP1Q1ED39 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
KNOP1Q1ED39 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
KNOP1Q1ED39 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
KNOP1Q1ED39 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
KNOP1Q1ED39 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
KNOP1Q1ED39 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
KNOP1Q1ED39 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KNOP1Q1ED39 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KNOP1Q1ED39 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KNOP1Q1ED39 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
KNOP1Q1ED39 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
KNOP1Q1ED39 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
KNOP1Q1ED39 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KNOP1Q1ED39 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
KNOP1Q1ED39 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
KNOP1Q1ED39 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KNOP1Q1ED39 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KNOP1Q1ED39 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
KNOP1Q1ED39 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
KNOP1Q1ED39 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
KNOP1Q1ED39 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
KNOP1Q1ED39 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
KNOP1Q1ED39 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
KNOP1Q1ED39 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KNOP1Q1ED39 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
KNOP1Q1ED39 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
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