Protein–RNA interactions for Protein: Q15629

TRAM1, Translocating chain-associated membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM1Q15629 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAM1Q15629 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAM1Q15629 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAM1Q15629 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAM1Q15629 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAM1Q15629 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAM1Q15629 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAM1Q15629 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAM1Q15629 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAM1Q15629 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAM1Q15629 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAM1Q15629 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAM1Q15629 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAM1Q15629 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAM1Q15629 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAM1Q15629 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAM1Q15629 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAM1Q15629 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAM1Q15629 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAM1Q15629 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAM1Q15629 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAM1Q15629 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAM1Q15629 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAM1Q15629 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAM1Q15629 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAM1Q15629 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAM1Q15629 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAM1Q15629 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAM1Q15629 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAM1Q15629 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAM1Q15629 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAM1Q15629 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAM1Q15629 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAM1Q15629 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAM1Q15629 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAM1Q15629 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAM1Q15629 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAM1Q15629 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAM1Q15629 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAM1Q15629 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAM1Q15629 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAM1Q15629 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAM1Q15629 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAM1Q15629 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAM1Q15629 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAM1Q15629 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAM1Q15629 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAM1Q15629 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAM1Q15629 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAM1Q15629 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAM1Q15629 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAM1Q15629 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAM1Q15629 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAM1Q15629 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAM1Q15629 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAM1Q15629 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAM1Q15629 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAM1Q15629 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAM1Q15629 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAM1Q15629 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAM1Q15629 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAM1Q15629 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAM1Q15629 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAM1Q15629 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAM1Q15629 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAM1Q15629 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAM1Q15629 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAM1Q15629 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAM1Q15629 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAM1Q15629 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAM1Q15629 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAM1Q15629 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAM1Q15629 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAM1Q15629 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAM1Q15629 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAM1Q15629 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAM1Q15629 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAM1Q15629 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAM1Q15629 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAM1Q15629 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAM1Q15629 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAM1Q15629 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAM1Q15629 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAM1Q15629 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAM1Q15629 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAM1Q15629 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAM1Q15629 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAM1Q15629 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAM1Q15629 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAM1Q15629 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAM1Q15629 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAM1Q15629 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAM1Q15629 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAM1Q15629 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAM1Q15629 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAM1Q15629 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAM1Q15629 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAM1Q15629 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAM1Q15629 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAM1Q15629 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms