Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LAPTM4AQ15012 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LAPTM4AQ15012 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LAPTM4AQ15012 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LAPTM4AQ15012 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LAPTM4AQ15012 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LAPTM4AQ15012 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LAPTM4AQ15012 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LAPTM4AQ15012 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LAPTM4AQ15012 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LAPTM4AQ15012 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LAPTM4AQ15012 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LAPTM4AQ15012 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LAPTM4AQ15012 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LAPTM4AQ15012 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LAPTM4AQ15012 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LAPTM4AQ15012 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LAPTM4AQ15012 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LAPTM4AQ15012 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LAPTM4AQ15012 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LAPTM4AQ15012 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LAPTM4AQ15012 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LAPTM4AQ15012 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LAPTM4AQ15012 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LAPTM4AQ15012 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LAPTM4AQ15012 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LAPTM4AQ15012 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LAPTM4AQ15012 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
LAPTM4AQ15012 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
LAPTM4AQ15012 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LAPTM4AQ15012 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LAPTM4AQ15012 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
LAPTM4AQ15012 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LAPTM4AQ15012 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
LAPTM4AQ15012 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LAPTM4AQ15012 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LAPTM4AQ15012 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LAPTM4AQ15012 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LAPTM4AQ15012 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LAPTM4AQ15012 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LAPTM4AQ15012 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LAPTM4AQ15012 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LAPTM4AQ15012 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LAPTM4AQ15012 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LAPTM4AQ15012 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LAPTM4AQ15012 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LAPTM4AQ15012 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LAPTM4AQ15012 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
LAPTM4AQ15012 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LAPTM4AQ15012 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LAPTM4AQ15012 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LAPTM4AQ15012 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
LAPTM4AQ15012 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LAPTM4AQ15012 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
LAPTM4AQ15012 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LAPTM4AQ15012 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LAPTM4AQ15012 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LAPTM4AQ15012 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LAPTM4AQ15012 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LAPTM4AQ15012 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LAPTM4AQ15012 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LAPTM4AQ15012 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LAPTM4AQ15012 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LAPTM4AQ15012 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LAPTM4AQ15012 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LAPTM4AQ15012 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LAPTM4AQ15012 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LAPTM4AQ15012 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LAPTM4AQ15012 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LAPTM4AQ15012 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LAPTM4AQ15012 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LAPTM4AQ15012 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LAPTM4AQ15012 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LAPTM4AQ15012 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LAPTM4AQ15012 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LAPTM4AQ15012 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LAPTM4AQ15012 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LAPTM4AQ15012 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LAPTM4AQ15012 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LAPTM4AQ15012 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LAPTM4AQ15012 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LAPTM4AQ15012 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LAPTM4AQ15012 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LAPTM4AQ15012 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LAPTM4AQ15012 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LAPTM4AQ15012 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LAPTM4AQ15012 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LAPTM4AQ15012 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LAPTM4AQ15012 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LAPTM4AQ15012 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LAPTM4AQ15012 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
LAPTM4AQ15012 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
LAPTM4AQ15012 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
LAPTM4AQ15012 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
LAPTM4AQ15012 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LAPTM4AQ15012 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LAPTM4AQ15012 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LAPTM4AQ15012 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LAPTM4AQ15012 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LAPTM4AQ15012 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
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