Protein–RNA interactions for Protein: Q14498

RBM39, RNA-binding protein 39, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39Q14498 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RBM39Q14498 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RBM39Q14498 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RBM39Q14498 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RBM39Q14498 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RBM39Q14498 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RBM39Q14498 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RBM39Q14498 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RBM39Q14498 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RBM39Q14498 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RBM39Q14498 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RBM39Q14498 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RBM39Q14498 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RBM39Q14498 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RBM39Q14498 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RBM39Q14498 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RBM39Q14498 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
RBM39Q14498 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RBM39Q14498 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RBM39Q14498 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RBM39Q14498 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RBM39Q14498 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RBM39Q14498 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RBM39Q14498 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RBM39Q14498 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
RBM39Q14498 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RBM39Q14498 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RBM39Q14498 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RBM39Q14498 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RBM39Q14498 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RBM39Q14498 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RBM39Q14498 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RBM39Q14498 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RBM39Q14498 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RBM39Q14498 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RBM39Q14498 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RBM39Q14498 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RBM39Q14498 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RBM39Q14498 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RBM39Q14498 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RBM39Q14498 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RBM39Q14498 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RBM39Q14498 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RBM39Q14498 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RBM39Q14498 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RBM39Q14498 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RBM39Q14498 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RBM39Q14498 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RBM39Q14498 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RBM39Q14498 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RBM39Q14498 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RBM39Q14498 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RBM39Q14498 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RBM39Q14498 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RBM39Q14498 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RBM39Q14498 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RBM39Q14498 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RBM39Q14498 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RBM39Q14498 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RBM39Q14498 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RBM39Q14498 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RBM39Q14498 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RBM39Q14498 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RBM39Q14498 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RBM39Q14498 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RBM39Q14498 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RBM39Q14498 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RBM39Q14498 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RBM39Q14498 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RBM39Q14498 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RBM39Q14498 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RBM39Q14498 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RBM39Q14498 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RBM39Q14498 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RBM39Q14498 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RBM39Q14498 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RBM39Q14498 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RBM39Q14498 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
RBM39Q14498 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RBM39Q14498 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RBM39Q14498 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RBM39Q14498 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RBM39Q14498 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RBM39Q14498 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RBM39Q14498 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RBM39Q14498 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RBM39Q14498 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RBM39Q14498 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RBM39Q14498 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RBM39Q14498 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RBM39Q14498 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RBM39Q14498 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RBM39Q14498 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RBM39Q14498 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RBM39Q14498 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RBM39Q14498 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RBM39Q14498 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RBM39Q14498 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RBM39Q14498 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RBM39Q14498 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
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