Protein–RNA interactions for Protein: Q14498

RBM39, RNA-binding protein 39, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 530 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39Q14498 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RBM39Q14498 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RBM39Q14498 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RBM39Q14498 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RBM39Q14498 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RBM39Q14498 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RBM39Q14498 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RBM39Q14498 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RBM39Q14498 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RBM39Q14498 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RBM39Q14498 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RBM39Q14498 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RBM39Q14498 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RBM39Q14498 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RBM39Q14498 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RBM39Q14498 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RBM39Q14498 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
RBM39Q14498 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RBM39Q14498 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RBM39Q14498 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RBM39Q14498 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RBM39Q14498 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RBM39Q14498 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RBM39Q14498 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RBM39Q14498 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
RBM39Q14498 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RBM39Q14498 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RBM39Q14498 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RBM39Q14498 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RBM39Q14498 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RBM39Q14498 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RBM39Q14498 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RBM39Q14498 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RBM39Q14498 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RBM39Q14498 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RBM39Q14498 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RBM39Q14498 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RBM39Q14498 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RBM39Q14498 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RBM39Q14498 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RBM39Q14498 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RBM39Q14498 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RBM39Q14498 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RBM39Q14498 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RBM39Q14498 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RBM39Q14498 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RBM39Q14498 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RBM39Q14498 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RBM39Q14498 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RBM39Q14498 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RBM39Q14498 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RBM39Q14498 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RBM39Q14498 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RBM39Q14498 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RBM39Q14498 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RBM39Q14498 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RBM39Q14498 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RBM39Q14498 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RBM39Q14498 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RBM39Q14498 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RBM39Q14498 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RBM39Q14498 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RBM39Q14498 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RBM39Q14498 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RBM39Q14498 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RBM39Q14498 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RBM39Q14498 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RBM39Q14498 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RBM39Q14498 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RBM39Q14498 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RBM39Q14498 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RBM39Q14498 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RBM39Q14498 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RBM39Q14498 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RBM39Q14498 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RBM39Q14498 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RBM39Q14498 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RBM39Q14498 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
RBM39Q14498 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RBM39Q14498 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RBM39Q14498 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RBM39Q14498 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RBM39Q14498 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RBM39Q14498 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RBM39Q14498 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RBM39Q14498 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RBM39Q14498 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RBM39Q14498 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RBM39Q14498 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RBM39Q14498 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RBM39Q14498 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RBM39Q14498 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RBM39Q14498 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RBM39Q14498 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RBM39Q14498 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RBM39Q14498 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RBM39Q14498 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RBM39Q14498 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RBM39Q14498 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RBM39Q14498 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
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