Protein–RNA interactions for Protein: Q14264

ERV3-1, Endogenous retrovirus group 3 member 1 Env polyprotein, humanhuman

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERV3-1Q14264 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERV3-1Q14264 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERV3-1Q14264 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERV3-1Q14264 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERV3-1Q14264 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERV3-1Q14264 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERV3-1Q14264 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERV3-1Q14264 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERV3-1Q14264 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERV3-1Q14264 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERV3-1Q14264 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERV3-1Q14264 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ERV3-1Q14264 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ERV3-1Q14264 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ERV3-1Q14264 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ERV3-1Q14264 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ERV3-1Q14264 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ERV3-1Q14264 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ERV3-1Q14264 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ERV3-1Q14264 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ERV3-1Q14264 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ERV3-1Q14264 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ERV3-1Q14264 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ERV3-1Q14264 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ERV3-1Q14264 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ERV3-1Q14264 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ERV3-1Q14264 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ERV3-1Q14264 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ERV3-1Q14264 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ERV3-1Q14264 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ERV3-1Q14264 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ERV3-1Q14264 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ERV3-1Q14264 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ERV3-1Q14264 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ERV3-1Q14264 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ERV3-1Q14264 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ERV3-1Q14264 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ERV3-1Q14264 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ERV3-1Q14264 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ERV3-1Q14264 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ERV3-1Q14264 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ERV3-1Q14264 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ERV3-1Q14264 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ERV3-1Q14264 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ERV3-1Q14264 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
ERV3-1Q14264 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ERV3-1Q14264 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ERV3-1Q14264 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ERV3-1Q14264 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ERV3-1Q14264 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ERV3-1Q14264 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ERV3-1Q14264 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ERV3-1Q14264 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ERV3-1Q14264 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ERV3-1Q14264 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ERV3-1Q14264 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ERV3-1Q14264 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ERV3-1Q14264 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ERV3-1Q14264 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERV3-1Q14264 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERV3-1Q14264 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERV3-1Q14264 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERV3-1Q14264 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERV3-1Q14264 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ERV3-1Q14264 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ERV3-1Q14264 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ERV3-1Q14264 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ERV3-1Q14264 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ERV3-1Q14264 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ERV3-1Q14264 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERV3-1Q14264 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ERV3-1Q14264 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERV3-1Q14264 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERV3-1Q14264 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ERV3-1Q14264 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ERV3-1Q14264 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ERV3-1Q14264 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ERV3-1Q14264 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ERV3-1Q14264 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ERV3-1Q14264 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ERV3-1Q14264 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ERV3-1Q14264 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERV3-1Q14264 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERV3-1Q14264 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ERV3-1Q14264 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ERV3-1Q14264 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ERV3-1Q14264 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ERV3-1Q14264 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ERV3-1Q14264 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ERV3-1Q14264 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ERV3-1Q14264 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ERV3-1Q14264 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ERV3-1Q14264 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ERV3-1Q14264 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERV3-1Q14264 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERV3-1Q14264 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ERV3-1Q14264 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ERV3-1Q14264 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ERV3-1Q14264 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ERV3-1Q14264 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
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