Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM25Q14258 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM25Q14258 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM25Q14258 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM25Q14258 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM25Q14258 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM25Q14258 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TRIM25Q14258 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TRIM25Q14258 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM25Q14258 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM25Q14258 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM25Q14258 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM25Q14258 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM25Q14258 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM25Q14258 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM25Q14258 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM25Q14258 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM25Q14258 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM25Q14258 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM25Q14258 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM25Q14258 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM25Q14258 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM25Q14258 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM25Q14258 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM25Q14258 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM25Q14258 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM25Q14258 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM25Q14258 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM25Q14258 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM25Q14258 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM25Q14258 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM25Q14258 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM25Q14258 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM25Q14258 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM25Q14258 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM25Q14258 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM25Q14258 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM25Q14258 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM25Q14258 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM25Q14258 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM25Q14258 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM25Q14258 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM25Q14258 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM25Q14258 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM25Q14258 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TRIM25Q14258 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM25Q14258 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM25Q14258 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM25Q14258 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM25Q14258 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM25Q14258 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM25Q14258 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM25Q14258 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM25Q14258 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM25Q14258 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM25Q14258 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM25Q14258 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM25Q14258 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM25Q14258 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM25Q14258 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM25Q14258 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM25Q14258 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM25Q14258 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM25Q14258 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM25Q14258 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM25Q14258 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM25Q14258 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM25Q14258 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM25Q14258 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM25Q14258 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM25Q14258 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM25Q14258 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM25Q14258 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM25Q14258 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRIM25Q14258 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRIM25Q14258 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM25Q14258 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM25Q14258 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM25Q14258 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM25Q14258 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM25Q14258 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM25Q14258 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM25Q14258 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM25Q14258 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM25Q14258 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM25Q14258 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM25Q14258 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM25Q14258 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM25Q14258 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM25Q14258 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM25Q14258 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM25Q14258 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM25Q14258 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM25Q14258 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM25Q14258 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM25Q14258 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM25Q14258 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM25Q14258 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM25Q14258 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM25Q14258 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms